RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-208ENST00000461648 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 RCSD1Q6JBY9 416 aa30■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 DGKHQ86XP1 1220 aa30■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 JMYQ8N9B5 988 aa30■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa30■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 TNKSO95271 1327 aa29.99■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 MCM5P33992 734 aa29.99■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 ANTXR2P58335 489 aa29.99■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 TREML2Q5T2D2 321 aa29.99■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 CHST3Q7LGC8 479 aa29.99■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 FAM43AQ8N2R8 423 aa29.99■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 TOP1P11387 765 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa29.98■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 ANKS1AQ92625 1134 aa29.98■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 LPAR1Q92633 364 aa29.98■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 TMEM47Q9BQJ4 181 aa29.98■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 PRC1O43663 620 aa29.97■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 RAD21O60216 631 aa29.97■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 SART3Q15020 963 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 SEC23AQ15436 765 aa29.97■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 ERICH2A1L162 156 aa29.96■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 F5H6K3 240 aa29.96■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 PDHXO00330 501 aa29.96■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 ALDH1A1P00352 501 aa29.96■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 VCAM1P19320 739 aa29.96■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 KLRC3Q07444 240 aa29.96■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 SPICE1Q8N0Z3 855 aa29.96■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa29.96■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 MTA3Q9BTC8 594 aa29.96■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa29.96■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 PSMA5P28066 241 aa29.95■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 ANAPC15P60006 121 aa29.95■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP29.95■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
TSC2-208ENST00000461648 WDR19Q8NEZ3 1342 aa29.95■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 NDUFB10O96000 172 aa29.94■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.94■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa29.94■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 TMEM87BQ96K49 555 aa29.94■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 BACH2Q9BYV9 841 aa29.94■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 RNF186Q9NXI6 227 aa29.94■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 CEP350Q5VT06 3117 aa29.94■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 WDR46O15213 610 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
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TSC2-208ENST00000461648 SLFN13Q68D06 897 aa29.93■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa29.93■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 BEGAINQ9BUH8 593 aa29.93■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 KAT14Q9H8E8 782 aa29.93■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 WBP1LQ9NX94 342 aa29.93■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 USP17L15C9J2P7 530 aa29.92■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 USP17L13C9JLJ4 530 aa29.92■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 USP17L11C9JVI0 530 aa29.92■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 USP17L18D6R9N7 530 aa29.92■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 USP17L22D6RA61 530 aa29.92■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 USP17L17D6RBQ6 530 aa29.92■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 USP17L19D6RCP7 530 aa29.92■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 USP17L20D6RJB6 530 aa29.92■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 CASTP20810 708 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
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TSC2-208ENST00000461648 USP17L24Q0WX57 530 aa29.92■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 TM6SF1Q9BZW5 370 aa29.92■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
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TSC2-208ENST00000461648 PNMA3Q9UL41 463 aa29.91■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 TRPA1O75762 1119 aa29.9■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.9■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa29.9■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 PNMA1Q8ND90 353 aa29.9■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 GMCL1Q96IK5 515 aa29.9■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 TCEANC2Q96MN5 208 aa29.9■■■□□ 2.38
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TSC2-208ENST00000461648 LRRC2Q9BYS8 371 aa29.9■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 C22orf23Q9BZE7 217 aa29.9■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 TANGO6Q9C0B7 1094 aa29.9■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa29.9■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 SAGE1Q9NXZ1 904 aa29.9■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 MTMR7Q9Y216 660 aa29.9■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 CA12O43570 354 aa29.89■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 RPS6KB1P23443 525 aa29.89■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 IL17RAQ96F46 866 aa29.89■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 LY9Q9HBG7 655 aa29.89■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 SENP2Q9HC62 589 aa29.89■■■□□ 2.38
TSC2-208ENST00000461648 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa29.89■■■□□ 2.38
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