RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 ATP2B2Q01814 1243 aa22.51■■□□□ 1.19
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CCDC78-204ENST00000439619 MB21D1Q8N884 522 aa22.51■■□□□ 1.19
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CCDC78-204ENST00000439619 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.51■■□□□ 1.19
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CCDC78-204ENST00000439619 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.47■■□□□ 1.19
CCDC78-204ENST00000439619 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.47■■□□□ 1.19
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CCDC78-204ENST00000439619 PLS1Q14651 629 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC78-204ENST00000439619 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.46■■□□□ 1.19
CCDC78-204ENST00000439619 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.46■■□□□ 1.19
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CCDC78-204ENST00000439619 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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CCDC78-204ENST00000439619 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC78-204ENST00000439619 NAPBQ9H115 298 aa22.43■■□□□ 1.18
CCDC78-204ENST00000439619 MYH7P12883 1935 aa22.42■■□□□ 1.18
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CCDC78-204ENST00000439619 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.42■■□□□ 1.18
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CCDC78-204ENST00000439619 ATG4CQ96DT6 458 aa22.42■■□□□ 1.18
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CCDC78-204ENST00000439619 SLC25A27O95847 323 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC78-204ENST00000439619 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.41■■□□□ 1.18
CCDC78-204ENST00000439619 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CCDC78-204ENST00000439619 MSCO60682 206 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC78-204ENST00000439619 ADORA2AP29274 412 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC78-204ENST00000439619 COPB2P35606 906 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC78-204ENST00000439619 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC78-204ENST00000439619 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCDC78-204ENST00000439619 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.4■■□□□ 1.18
CCDC78-204ENST00000439619 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCDC78-204ENST00000439619 TSPY3P0CV98 308 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 TSPY8P0CW00 308 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 FCER1AP12319 257 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 CNGA1P29973 690 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.39■■□□□ 1.17
CCDC78-204ENST00000439619 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.39■■□□□ 1.17
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