RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 IFT22Q9H7X7 185 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PNMA2Q9UL42 364 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.01□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 H3BRJ5 948 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 KPNA6O60684 536 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXO21O94952 628 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 CAPNS1P04632 268 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 EPHX1P07099 455 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 JMJD7P0C870 316 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PYGMP11217 842 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 GRK4P32298 578 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 IGFALSP35858 605 aa6□□□□□ -1.45
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CBX1P4-201ENST00000439415 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF460Q14592 562 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 POU4F3Q15319 338 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM13CQ8NE31 585 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC6A18Q96N87 628 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 FBRSQ9HAH7 460 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 OSGEPQ9NPF4 335 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 OBP2AQ9NY56 170 aa6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 TNKSO95271 1327 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 NEMP1O14524 444 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 RGS13O14921 159 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 APBA3O96018 575 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 BPIP17213 487 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 EPHA1P21709 976 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 FGFR3P22607 806 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ARL4DP49703 201 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 CFAP100Q494V2 611 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 FGD2Q7Z6J4 655 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SYT9Q86SS6 491 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM192Q8IY95 271 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SLFN12Q8IYM2 578 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PPM1EQ8WY54 764 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 GMCL1Q96IK5 515 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 GBP3Q9H0R5 595 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC4BQ9NT99 713 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PHF24Q9UPV7 400 aa5.99□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
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CBX1P4-201ENST00000439415 B4E1Z4 1266 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 NOP56O00567 594 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF862O60290 1169 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SIN3BO75182 1162 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 F2P00734 622 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM27P14373 513 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE6BP35913 854 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 GRIA2P42262 883 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 DGKGP49619 791 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SCNN1BP51168 640 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 SETDB1Q15047 1291 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 DBN1Q16643 649 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 C12orf40Q86WS4 652 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKLE2Q86XL3 938 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM22Q8IYM9 498 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 IFNL3Q8IZI9 196 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 BVESQ8NE79 360 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 COG1Q8WTW3 980 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 E2F7Q96AV8 911 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 FGD4Q96M96 766 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 MENTQ9BUN1 341 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 WNT10AQ9GZT5 417 aa5.98□□□□□ -1.45
CBX1P4-201ENST00000439415 KLHL25Q9H0H3 589 aa5.98□□□□□ -1.45
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