RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 DCUN1D2Q6PH85 259 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PEX26Q7Z412 305 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 EYA3Q99504 573 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 GPCPD1Q9NPB8 672 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 JAG2Q9Y219 1238 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PRDM1O75626 825 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 MTX1Q13505 466 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPC3Q13507 836 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC105Q8IYK2 499 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX29Q8TEQ0 813 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 EYA1Q99502 592 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 LONRF3Q496Y0 759 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT40Q6A162 431 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM2BQ8NHM5 1336 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 CALUO43852 315 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 IL2RBP14784 551 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 POSTNQ15063 836 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 TNNI3KQ59H18 835 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 KBTBD3Q8NAB2 608 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 VCXQ9H320 206 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOC7Q9UPT5 735 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 USP54Q70EL1 1684 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K5Q99683 1374 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 CHMP2AO43633 222 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF40O75150 1001 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 SYCE1Q8N0S2 351 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 JDP2Q8WYK2 163 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM89AQ96GI7 184 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOC3O60645 756 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 STK10O94804 968 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 IQSEC2Q5JU85 1478 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3TC1Q8TE82 1336 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 G2E3Q7L622 706 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP120Q8N960 986 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM227BQ96M60 508 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 NWD1Q149M9 1564 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 DAPK3O43293 454 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT25Q7Z3Z0 450 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 WWC3Q9ULE0 1092 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 SAR1BQ9Y6B6 198 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 SSH2Q76I76 1423 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 AOX1Q06278 1338 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 I3L4J1 428 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 TXNDC9O14530 226 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM114A2Q9NRY5 505 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 LMBRD1Q9NUN5 540 aa12.18□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 CD19P15391 556 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 RASSF2P50749 326 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 ZSCAN26Q16670 478 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 OR8K1Q8NGG5 319 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF34Q969K3 372 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 RIMBP2O15034 1052 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF853P0CG23 659 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 BCRP11274 1271 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 ERCC3P19447 782 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PPARDQ03181 441 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP2R5DQ14738 602 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 BRD3Q15059 726 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 DYMQ7RTS9 669 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 STAMQ92783 540 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 ARMT1Q9H993 441 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 DNM3Q9UQ16 869 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 MSH6P52701 1360 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB17Q9H0T7 212 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 NLRC4Q9NPP4 1024 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF521Q96K83 1311 aa12.17□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 STRN3Q13033 797 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 SFMBT2Q5VUG0 894 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PHKBQ93100 1093 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC51Q96ER9 411 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM63CQ9P1W3 806 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 DENND2CQ68D51 928 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 IQCDQ96DY2 449 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PLCB1Q9NQ66 1216 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 HOMER3Q9NSC5 361 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 USTQ9Y2C2 406 aa12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms