RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383917.1

RNU6-1279P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1279, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1279P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1279P-201ENST00000383917 GSDMAQ96QA5 445 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 DNAJC7Q99615 494 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 LZTS2Q9BRK4 669 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 RBSNQ9H1K0 784 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 DEF6Q9H4E7 631 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 CNNM2Q9H8M5 875 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 ZNF408Q9H9D4 720 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 KANSL2Q9H9L4 492 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 CABP2Q9NPB3 220 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 TBK1Q9UHD2 729 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 KNSTRNQ9Y448 316 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 ITIH6Q6UXX5 1313 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PASKQ96RG2 1323 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 CEP152O94986 1710 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PKD1L3Q7Z443 1732 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 KLHL33A6NCF5 533 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 AKAP10O43572 662 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PIP5K1CO60331 668 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 NBNO60934 754 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 COBLO75128 1261 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 TYRP1P17643 537 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 XBP1P17861 261 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 ATP6V1E1P36543 226 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 BCAMP50895 628 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 GUCY2FP51841 1108 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 NEK2P51955 445 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 UBASH3AP57075 661 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 KRT83P78385 493 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PFKPQ01813 784 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 DPYDQ12882 1025 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PRKG2Q13237 762 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 WTAPQ15007 396 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 AGAP9Q5VTM2 703 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 NXNQ6DKJ4 435 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 CHADLQ6NUI6 762 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PASD1Q8IV76 773 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 SYNPOQ8N3V7 929 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 GSDMBQ8TAX9 411 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 MAML1Q92585 1016 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 TRIM63Q969Q1 353 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 SH3KBP1Q96B97 665 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 CRELD1Q96HD1 420 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 CYP4F11Q9HBI6 524 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 RASSF1Q9NS23 344 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 LRRC4BQ9NT99 713 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 GTF3C4Q9UKN8 822 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PCDHB8Q9UN66 801 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PLAAQ9Y263 795 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 CACNA1BQ00975 2339 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 QSER1Q2KHR3 1735 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 GPRASP1Q5JY77 1395 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PIK3CDO00329 1044 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 FAM13AO94988 1023 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 DESP17661 470 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 HSPA4P34932 840 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 SOX5P35711 763 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 RENBPP51606 427 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 SESN3P58005 492 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 BPIFB3P59826 476 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 SARNPP82979 210 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 APBA1Q02410 837 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 EHHADHQ08426 723 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 KRT72Q14CN4 511 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PLCB4Q15147 1175 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PPP2R5BQ15173 497 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 FXNQ16595 210 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 INF2Q27J81 1249 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 AMOTQ4VCS5 1084 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1279P-201ENST00000383917 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms