RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-204ENST00000373436 BRD1O95696 1058 aa23.36■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 TTLL1O95922 423 aa23.36■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 NOVP48745 357 aa23.36■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 DGKHQ86XP1 1220 aa23.36■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.36■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 ATP2B2Q01814 1243 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 GBP4Q96PP9 640 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 LY9Q9HBG7 655 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 NYAP2Q9P242 653 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 MCM4P33991 863 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 WTAPQ15007 396 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 ERO1BQ86YB8 467 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 SENP2Q9HC62 589 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.35■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.34■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.34■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 ACER1Q8TDN7 264 aa23.34■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 ANKS1AQ92625 1134 aa23.34■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 A0A1W2PRG0 241 aa23.33■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 JAK2O60674 1132 aa23.33■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 SYT1P21579 422 aa23.33■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 ECE1P42892 770 aa23.33■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 APLP1P51693 650 aa23.33■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 PPATQ06203 517 aa23.33■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 OPTNQ96CV9 577 aa23.33■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 OTUD5Q96G74 571 aa23.33■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.33■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.33■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.33■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 LIFRP42702 1097 aa23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 MKL1Q969V6 931 aa23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 WDR18Q9BV38 432 aa23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 PTPRFP10586 1907 aa23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 STX6O43752 255 aa23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 C1QTNF8P60827 252 aa23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 SPP2Q13103 211 aa23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 TMTC2Q8N394 836 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 KAT14Q9H8E8 782 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 CREBZFQ9NS37 354 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 TMX2Q9Y320 296 aa23.31■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 TRIM75PA6NK02 468 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 IRF6O14896 467 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 CTDNEP1O95476 244 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 GJA5P36382 358 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 PPIL2Q13356 520 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 FEZ1Q99689 392 aa23.3■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 USP17L10C9JJH3 530 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 MTMR2Q13614 643 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 RGMBQ6NW40 437 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 APOA5Q6Q788 366 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 PNMA1Q8ND90 353 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 DDX11Q96FC9 970 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 WNK4Q96J92 1243 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 SH2D4AQ9H788 454 aa23.29■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC69A6NI79 296 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 BACE1P56817 501 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 PDCP20941 246 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.28■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 ZBTB43O43298 467 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 MICU3Q86XE3 530 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 MTMR6Q9Y217 621 aa23.27■■□□□ 1.32
RALGPS1-204ENST00000373436 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms