RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 RPS6KA1Q15418 735 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 STIM2Q9P246 746 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP157Q5JU67 520 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 ERCC3P19447 782 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 KLRF2D3W0D1 207 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 SCG2P13521 617 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 TPH2Q8IWU9 490 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 CD19P15391 556 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 MAP4K1Q92918 833 aa22.47■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 RRAGAQ7L523 313 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 APBA3O96018 575 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 PEX26Q7Z412 305 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 VIMP08670 466 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 CHRNDQ07001 517 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 BTBD18B2RXH4 712 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 NR1I2O75469 434 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 PAK2Q13177 524 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 NEK8Q86SG6 692 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 UIMC1Q96RL1 719 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 CIAO1O76071 339 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 DAAM2Q86T65 1068 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 DDAH1O94760 285 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 RNF34Q969K3 372 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 SIK1P57059 783 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 OR52Z1P0C646 297 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 PSMC4P43686 418 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 ELF2Q15723 593 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 GNPTABQ3T906 1256 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 LONRF3Q496Y0 759 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 GREM2Q9H772 168 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 STAT1P42224 750 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 RGS12O14924 1447 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 H7C1D1 291 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 GPBP1Q86WP2 473 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC110Q8TBZ0 833 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFAB1O14561 156 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 DAPK3O43293 454 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 RASA3Q14644 834 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 MED23Q9ULK4 1368 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 PHKA1P46020 1223 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 CEP57Q86XR8 500 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6CA6NDK9 693 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6DP0CG33 693 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 PRKG1Q13976 671 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 PSMB7Q99436 277 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 SWAP70Q9UH65 585 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 ADCY9O60503 1353 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 KCNJ18B7U540 433 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-203ENST00000366687 KCNJ12Q14500 433 aa22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms