RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFRSF10CO14798 259 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 GJA8P48165 433 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC23A3Q6PIS1 610 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBE2FQ969M7 185 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR62Q9BZJ7 368 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACBD3Q9H3P7 528 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 GINM1Q9NU53 330 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRN2O75325 713 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC3AO75596 197 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC81Q6ZN84 652 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 VWCEQ96DN2 955 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRFP11831 508 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOX9P48436 509 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC6A18Q96N87 628 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC9A7Q96T83 725 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 TM9SF2Q99805 663 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUSP13Q9UII6 198 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 SHISA3A0PJX4 238 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACRP10323 421 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 GUCY2CP25092 1073 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 NASPP49321 788 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 CREG2Q8IUH2 290 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM192Q8IY95 271 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRN4CLQ8ND94 238 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRBNQ96SW2 442 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 WASH4PA8MWX3 477 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 BIN1O00499 593 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESR1P03372 595 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 LTKP29376 864 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF6P56537 245 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAB4Q2WGN9 574 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 RUFY4Q6ZNE9 571 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 E9PSI1 815 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGB5P18084 799 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 NBPF9Q3BBW0 867 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPLX3Q8WVH0 158 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHRS1Q96LJ7 313 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAPN10Q9HC96 672 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAPLNO95428 1278 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 GIPRP48546 466 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMS1P54277 932 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 EGR3Q06889 387 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMC3Q7Z5M5 1100 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC120Q96HB5 630 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 HDAC8Q9BY41 377 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM59LQ9UK28 342 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 STRIP2Q9ULQ0 834 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 C9IYK1 514 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAX4O43316 350 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIGLEC6O43699 453 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 GDNFP39905 211 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 UNC5AQ6ZN44 842 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.8 ms