RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 ATP7BP35670 1465 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 M0R2C6 588 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 GPATCH11Q8N954 259 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 RDH13Q8NBN7 331 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 INF2Q27J81 1249 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 PNMA1Q8ND90 353 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 KCNQ4P56696 695 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 USP28Q96RU2 1077 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 TXNDC16Q9P2K2 825 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 MED23Q9ULK4 1368 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 LIN9Q5TKA1 542 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 STAP2Q9UGK3 403 aa23.42■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.42■■□□□ 1.34
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SMURF1-201ENST00000361125 CFAP58Q5T655 872 aa23.41■■□□□ 1.34
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SMURF1-201ENST00000361125 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.41■■□□□ 1.34
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SMURF1-201ENST00000361125 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.41■■□□□ 1.34
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SMURF1-201ENST00000361125 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.41■■□□□ 1.34
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SMURF1-201ENST00000361125 PDE8BO95263 885 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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SMURF1-201ENST00000361125 ARHGAP6O43182 974 aa23.4■■□□□ 1.34
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SMURF1-201ENST00000361125 USTQ9Y2C2 406 aa23.4■■□□□ 1.34
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SMURF1-201ENST00000361125 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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SMURF1-201ENST00000361125 ZBTB16Q05516 673 aa23.4■■□□□ 1.34
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SMURF1-201ENST00000361125 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 C8orf74Q6P047 294 aa23.39■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 GPBP1Q86WP2 473 aa23.39■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.39■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.39■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.39■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 SCRN1Q12765 414 aa23.39■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 ANKS4BQ8N8V4 417 aa23.39■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 CLIC6Q96NY7 704 aa23.39■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.39■■□□□ 1.34
SMURF1-201ENST00000361125 KLRF2D3W0D1 207 aa23.39■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 H7C1D1 291 aa23.39■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.39■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.39■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 RASA3Q14644 834 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 TTC14Q96N46 770 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 ALAS1P13196 640 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 ERFEQ4G0M1 354 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM31Q9BZY9 425 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 COPRSQ9NQ92 184 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 SLC8A3P57103 927 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 CLIC4Q9Y696 253 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 EBAG9O00559 213 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 TUBB2AQ13885 445 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 SFMBT2Q5VUG0 894 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 RASEFQ8IZ41 740 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 FAM76AQ8TAV0 307 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.38■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 CPLX4Q7Z7G2 160 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 KIF1BO60333 1816 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 NDC80O14777 642 aa23.37■■□□□ 1.33
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