RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.55■□□□□ 0.88
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PDE4D-204ENST00000358923 CEP95Q96GE4 821 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4D-204ENST00000358923 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.55■□□□□ 0.88
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PDE4D-204ENST00000358923 BIN1O00499 593 aa20.52■□□□□ 0.87
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PDE4D-204ENST00000358923 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.5■□□□□ 0.87
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PDE4D-204ENST00000358923 PTPAQ15257 358 aa20.49■□□□□ 0.87
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PDE4D-204ENST00000358923 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.49■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 CNKSR1Q969H4 720 aa20.49■□□□□ 0.87
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PDE4D-204ENST00000358923 CLRN2A0PK11 232 aa20.49■□□□□ 0.87
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PDE4D-204ENST00000358923 PODNQ7Z5L7 613 aa20.49■□□□□ 0.87
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PDE4D-204ENST00000358923 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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PDE4D-204ENST00000358923 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.48■□□□□ 0.87
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PDE4D-204ENST00000358923 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.48■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 SLC39A14Q15043 492 aa20.48■□□□□ 0.87
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PDE4D-204ENST00000358923 SDF4Q9BRK5 362 aa20.48■□□□□ 0.87
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PDE4D-204ENST00000358923 ZNF174Q15697 407 aa20.47■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 ADALQ6DHV7 355 aa20.47■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 TTLL6Q8N841 843 aa20.47■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 DNAJC18Q9H819 358 aa20.47■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.47■□□□□ 0.87
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PDE4D-204ENST00000358923 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PDE4D-204ENST00000358923 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.47■□□□□ 0.87
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