RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 FLRT1Q9NZU1 646 aa18.35■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 ALPK3Q96L96 1907 aa18.35■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 IGHA2P01877 340 aa18.34■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 CAPN2P17655 700 aa18.34■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 PTPREP23469 700 aa18.34■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 MAP2K5Q13163 448 aa18.34■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 APPBP2Q92624 585 aa18.34■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 CRBNQ96SW2 442 aa18.34■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 PARP14Q460N5 1801 aa18.34■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 SALL3Q9BXA9 1300 aa18.33■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 M0R2C6 588 aa18.33■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 RGS2P41220 211 aa18.33■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 ICA1Q05084 483 aa18.33■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 SPICE1Q8N0Z3 855 aa18.33■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 NPLOC4Q8TAT6 608 aa18.33■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 VCPKMTQ9H867 229 aa18.33■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 HOXC10Q9NYD6 342 aa18.33■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 OGDHLQ9ULD0 1010 aa18.33■□□□□ 0.53
CTSW-201ENST00000307886 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 A0A0G2JMZ2 1700 aa18.33■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 SLC15A5A6NIM6 579 aa18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 EEF2P13639 858 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 DSG3P32926 999 aa18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 GRB14Q14449 540 aa18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 LHX8Q68G74 356 aa18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 GPATCH3Q96I76 525 aa18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 APBA2Q99767 749 aa18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 HTATIP2Q9BUP3 242 aa18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 SZT2Q5T011 3432 aa18.32■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 GPAA1O43292 621 aa18.31■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 RASA1P20936 1047 aa18.31■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 CCNA1P78396 465 aa18.31■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 LPAR1Q92633 364 aa18.31■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 DDRGK1Q96HY6 314 aa18.31■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.31■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 PRO3102Q9H379 93 aa18.31■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa18.31■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 HOXC6P09630 235 aa18.3■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 STK11IPQ8N1F8 1099 aa18.3■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 ANKLE1Q8NAG6 615 aa18.3■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 ATG4CQ96DT6 458 aa18.3■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 SPATC1LQ9H0A9 340 aa18.3■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 KANSL2Q9H9L4 492 aa18.3■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa18.3■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 ROBO3Q96MS0 1386 aa18.3■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 WDR78Q5VTH9 848 aa18.29■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 NECAB2Q7Z6G3 386 aa18.29■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 AMOTL1Q8IY63 956 aa18.29■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 FBXO28Q9NVF7 368 aa18.29■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 MINDY4BA8MYZ0 360 aa18.28■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 FLOT1O75955 427 aa18.28■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 ERCC3P19447 782 aa18.28■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 CHRDL2Q6WN34 429 aa18.28■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa18.28■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 ERC2O15083 957 aa18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 FOXP2O15409 715 aa18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 COBLO75128 1261 aa18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 MX1P20591 662 aa18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 TMEM132BQ14DG7 1078 aa18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 IFNL3Q8IZI9 196 aa18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 MB21D1Q8N884 522 aa18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 SHCBP1Q8NEM2 672 aa18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 TRPV1Q8NER1 839 aa18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 SH2D4AQ9H788 454 aa18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 PFASO15067 1338 aa18.27■□□□□ 0.52
CTSW-201ENST00000307886 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
CTSW-201ENST00000307886 ZNF236Q9UL36 1845 aa18.27■□□□□ 0.51
CTSW-201ENST00000307886 STRNO43815 780 aa18.26■□□□□ 0.51
CTSW-201ENST00000307886 EVI5O60447 810 aa18.26■□□□□ 0.51
CTSW-201ENST00000307886 GNAT2P19087 354 aa18.26■□□□□ 0.51
CTSW-201ENST00000307886 ADORA2AP29274 412 aa18.26■□□□□ 0.51
CTSW-201ENST00000307886 CYP2C19P33261 490 aa18.26■□□□□ 0.51
CTSW-201ENST00000307886 ATP2B2Q01814 1243 aa18.26■□□□□ 0.51
CTSW-201ENST00000307886 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CTSW-201ENST00000307886 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.26■□□□□ 0.51
CTSW-201ENST00000307886 NBPF3Q9H094 633 aa18.26■□□□□ 0.51
CTSW-201ENST00000307886 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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