RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 TMTC2Q8N394 836 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 SETDB2Q96T68 719 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 FUT8Q9BYC5 575 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 GNPATO15228 680 aa22.89■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 ATP8B1O43520 1251 aa22.89■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 RPS6KA4O75676 772 aa22.89■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 DEXIO95424 95 aa22.89■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 MYL5Q02045 173 aa22.89■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 NR5A1Q13285 461 aa22.89■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 ESR2Q92731 530 aa22.89■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.89■■□□□ 1.26
HPS6-201ENST00000299238 TNKSO95271 1327 aa22.89■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 FANCBQ8NB91 859 aa22.89■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 CNNM3Q8NE01 707 aa22.89■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 FAM212AQ96EL1 285 aa22.89■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.89■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 SEC23AQ15436 765 aa22.88■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.88■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 NLRP3Q96P20 1036 aa22.88■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 VPS18Q9P253 973 aa22.88■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.88■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 BMP6P22004 513 aa22.88■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 PTPREP23469 700 aa22.88■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 LAMB1P07942 1786 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 SEMA3EO15041 775 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 SERPINC1P01008 464 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 TMEM232C9JQI7 657 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 ZPR1O75312 459 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 KCNJ6P48051 423 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 UBASH3AP57075 661 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 PDE4BQ07343 736 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 ZNF827Q17R98 1081 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 CFAP100Q494V2 611 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 PDILTQ8N807 584 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 FANCLQ9NW38 375 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 EFCAB8A8MWE9 144 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 IVLP07476 585 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 OXER1Q8TDS5 423 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 SHISA4Q96DD7 197 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 DONSONQ9NYP3 566 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 SUFUQ9UMX1 484 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.85■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 GSCP56915 257 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 PPM1EQ8WY54 764 aa22.85■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.85■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.85■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 CORO7P57737 925 aa22.84■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 MCTP2Q6DN12 878 aa22.84■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.84■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 MECOMQ03112 1051 aa22.84■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 OLFM4Q6UX06 510 aa22.84■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.84■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.84■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 USP49Q70CQ1 688 aa22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 LY75O60449 1722 aa22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 PRDM1O75626 825 aa22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 FAM182BQ5T319 152 aa22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HPS6-201ENST00000299238 FAM205CA6NFA0 338 aa22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms