RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299194.5

LRTM2-201, Transcript of leucine rich repeats and transmembrane domains 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRTM2, Length 3,688 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTM2-201ENST00000299194 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 TRIM49BA6NDI0 452 aa14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 IDEP14735 1019 aa14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 DNA2P51530 1060 aa14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 TICAM2Q86XR7 235 aa14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 SLFN14P0C7P3 912 aa14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 NELFBQ8WX92 580 aa14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.68□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 RIMBP2O15034 1052 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 ADAMTS3O15072 1205 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 NAPAP54920 295 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 STK36Q9NRP7 1315 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 KRT9P35527 623 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 PKN1Q16512 942 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 SOGA3Q5TF21 947 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 KIF1AQ12756 1690 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 MORC3Q14149 939 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 DRC1Q96MC2 740 aa14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 CALM1P0DP23 149 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 CALM2P0DP24 149 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 CALM3P0DP25 149 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 SPATA1Q5VX52 437 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 TC2NQ8N9U0 490 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 DCCP43146 1447 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 FAM170AA1A519 330 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 DMTNQ08495 405 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 TROAPQ12815 778 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 SEC23AQ15436 765 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 TFR2Q9UP52 801 aa14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 PHACTR2O75167 634 aa14.65□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 ASIC1P78348 528 aa14.65□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 BLIDQ8IZY5 108 aa14.65□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 GYS2P54840 703 aa14.65□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 PAK1Q13153 545 aa14.65□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.65□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.65□□□□□ -0.06
LRTM2-201ENST00000299194 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 KIAA1328Q86T90 577 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 FERMT2Q96AC1 680 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 SHISA4Q96DD7 197 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 CAGE1Q8TC20 777 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 TNS2Q63HR2 1409 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 ENC1O14682 589 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 STX10O60499 249 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 TXKP42681 527 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 STIM1Q13586 685 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 HPS3Q969F9 1004 aa14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 BAG3O95817 575 aa14.63□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.63□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 DYMQ7RTS9 669 aa14.63□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 KCNJ18B7U540 433 aa14.63□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 UFL1O94874 794 aa14.63□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 FAM193AP78312 1265 aa14.63□□□□□ -0.07
LRTM2-201ENST00000299194 KCNJ12Q14500 433 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms