RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 F13A1P00488 732 aa20.37■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 HLA-DOAP06340 250 aa20.37■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 RXRAP19793 462 aa20.37■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 INPP5BP32019 993 aa20.37■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 MAP3K10Q02779 954 aa20.37■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 SREBF2Q12772 1141 aa20.37■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 MICU3Q86XE3 530 aa20.37■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 MYL10Q9BUA6 226 aa20.37■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 SIPA1L1O43166 1804 aa20.36■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 FDPSP14324 419 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 CDC27P30260 824 aa20.36■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 INHBEP58166 350 aa20.36■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.36■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 ERO1BQ86YB8 467 aa20.36■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.36■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.36■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 GOLGA8AA7E2F4 631 aa20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 FOXN1O15353 648 aa20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 PPFIA3O75145 1194 aa20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 MCTP1Q6DN14 999 aa20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 IQCA1Q86XH1 822 aa20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 TMTC2Q8N394 836 aa20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 OTUD5Q96G74 571 aa20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.35■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.34■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.34■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 TTC6Q86TZ1 520 aa20.34■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.34■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.34■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.34■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 PICK1Q9NRD5 415 aa20.34■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.33■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 NMT2O60551 498 aa20.33■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 TM4SF4P48230 202 aa20.33■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 NT5C2P49902 561 aa20.33■□□□□ 0.85
SRSF1-201ENST00000258962 PCNTO95613 3336 aa20.33■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 TSPY2A6NKD2 308 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 FAM196BA6NMK8 535 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 CPLX1O14810 134 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 RASA1P20936 1047 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 GJA5P36382 358 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 RCAN1P53805 252 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 NTRK3Q16288 839 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 MYH6P13533 1939 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 TRPA1O75762 1119 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 SLURP2P0DP57 97 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 CDK8P49336 464 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 GTF2A2P52657 109 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 TFAP4Q01664 338 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 PPATQ06203 517 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 RNF186Q9NXI6 227 aa20.32■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.31■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.31■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.31■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.31■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 SAGE1Q9NXZ1 904 aa20.31■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 KIF3AQ9Y496 699 aa20.31■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 OTOFQ9HC10 1997 aa20.31■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 GABPAQ06546 454 aa20.3■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 PPIL2Q13356 520 aa20.3■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 RTN1Q16799 776 aa20.3■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 FERMT3Q86UX7 667 aa20.3■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.3■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 IRF6O14896 467 aa20.29■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 TRAK2O60296 914 aa20.29■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 ALDH1A1P00352 501 aa20.29■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 LBX1P52954 281 aa20.29■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 FOSBP53539 338 aa20.29■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 SNAPC2Q13487 334 aa20.29■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 TSKSQ9UJT2 592 aa20.29■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SRSF1-201ENST00000258962 CDKL5O76039 1030 aa20.28■□□□□ 0.84
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