RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637919.1

PLCB1-233, Transcript of phospholipase C beta 1, human

TSL 5 BASIC

Gene PLCB1, Length 5,074 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLCB1-233	ENST00000637919	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	UTRN	P46939	3433 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	MTX1	Q13505	466 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	TACC1	O75410	805 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	RWDD2B	P57060	319 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	TRAF1	Q13077	416 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919	LY75	O60449	1722 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PLCB1-233	ENST00000637919		F6X3S4	739 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC8A3	P57103	927 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	IFT20	Q8IY31	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	AIDA	Q96BJ3	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	BCL9	O00512	1426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RREB1	Q92766	1687 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919		A0A1B0GVL5	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CYP27B1	O15528	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ZEB2	O60315	1214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PFKFB2	O60825	505 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PIGB	Q92521	554 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63	2e-7	■□□□□ 9.4
PLCB1-233	ENST00000637919	C21orf2	O43822	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ADRA2B	P18089	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RASEF	Q8IZ41	740 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TSKS	Q9UJT2	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	BMP15	O95972	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PAK2	Q13177	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	RMND1	Q9NWS8	449 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919		H3BQF6	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SASH3	O75995	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CPA1	P15085	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PRPH	P41219	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NT5C2	P49902	561 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	SMTN	P53814	917 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	EPHB4	P54760	987 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	ICA1	Q05084	483 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	TAF4B	Q92750	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	VCX	Q9H320	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	FSBP	O95073	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	MMP10	P09238	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PLCB1-233	ENST00000637919	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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