RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634086.1

APOO-208, Transcript of apolipoprotein O, human

TSL 3

Gene APOO, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APOO-208	ENST00000634086	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APOO-208	ENST00000634086	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
APOO-208	ENST00000634086	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APOO-208	ENST00000634086	SP110	Q9HB58	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APOO-208	ENST00000634086	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.91	□□□□□ -1.62
APOO-208	ENST00000634086	SEMA7A	O75326	666 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	GRK4	P32298	578 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	OXR1	Q8N573	874 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		4.9	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	PEX10	O60683	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	EGR3	Q06889	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	DSC3	Q14574	896 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	TRIM13	O60858	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	PDE6B	P35913	854 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	ETV3	P41162	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	GAB4	Q2WGN9	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086		Q96M66	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	RFXAP	O00287	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	TREH	O43280	583 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	SASH1	O94885	1247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	LTK	P29376	864 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	MAPK8	P45983	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	SSPN	Q14714	243 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	NR0B2	Q15466	257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	GFRA2	O00451	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	GIPC1	O14908	333 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	PGR	P06401	933 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	GALK1	P51570	392 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	GGN	Q86UU5	652 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	FBF1	Q8TES7	1133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	SETDB2	Q96T68	719 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		4.85	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	PI3	P19957	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	LMNB1	P20700	586 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	MAPK1	P28482	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	SNX17	Q15036	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APOO-208	ENST00000634086	PSPN	O60542	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APOO-208	ENST00000634086	CELA3B	P08861	270 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APOO-208	ENST00000634086	USP17L7	P0C7H9	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APOO-208	ENST00000634086	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APOO-208	ENST00000634086	CHRNE	Q04844	493 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APOO-208	ENST00000634086	SEPT6	Q14141	434 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APOO-208	ENST00000634086	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
APOO-208	ENST00000634086	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APOO-208	ENST00000634086	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APOO-208	ENST00000634086	C12orf49	Q9H741	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
APOO-208	ENST00000634086	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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