RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		19.83	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	RILPL2	Q969X0	211 aa		19.83	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		19.83	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		19.82	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		19.82	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		19.82	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		19.82	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTPRF	P10586	1907 aa		19.81	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	CAP1	Q01518	475 aa		19.81	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		19.81	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		19.81	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		19.81	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		19.81	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		19.81	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	AKR1B1	P15121	316 aa		19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	GUCY1A2	P33402	732 aa		19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	SOX10	P56693	466 aa		19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	TICAM2	Q86XR7	235 aa		19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAET1E	Q8TD07	263 aa		19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACER1	Q8TDN7	264 aa		19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM47	Q96LD4	638 aa		19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	NAPB	Q9H115	298 aa		19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	SH2D4A	Q9H788	454 aa		19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	SRRD	Q9UH36	339 aa		19.8	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L15	C9J2P7	530 aa		19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L11	C9JVI0	530 aa		19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L18	D6R9N7	530 aa		19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L22	D6RA61	530 aa		19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L19	D6RCP7	530 aa		19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L20	D6RJB6	530 aa		19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L24	Q0WX57	530 aa		19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	COA7	Q96BR5	231 aa		19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	C12orf42	Q96LP6	360 aa		19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		19.79	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYPN	Q86TC9	1320 aa		19.78	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMIM22	K7EJ46	135 aa		19.78	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	HERVK_113	P62684	666 aa		19.78	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP2B2	Q01814	1243 aa		19.78	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	ICA1	Q05084	483 aa		19.78	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		19.78	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		19.78	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	CTGF	P29279	349 aa		19.77	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		19.77	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	19.77	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		19.77	■□□□□ 0.76
JMJD1C-211	ENST00000633035	VCAM1	P19320	739 aa		19.76	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDE4B	Q07343	736 aa		19.76	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		19.76	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		19.76	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARMC5	Q96C12	935 aa		19.76	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		19.76	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1W2PRG0	241 aa		19.75	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	RGS19	P49795	217 aa		19.75	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		19.75	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		19.75	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	19.75	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAD21	O60216	631 aa		19.74	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	19.74	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	19.74	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRKCZ	Q05513	592 aa		19.74	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		19.74	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	LPAR1	Q92633	364 aa		19.74	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM227B	Q96M60	508 aa		19.74	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		19.74	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		19.74	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMX2	Q9Y320	296 aa		19.74	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	HIP1	O00291	1037 aa		19.73	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	SDS	P20132	328 aa		19.73	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	RASA1	P20936	1047 aa		19.73	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRK4	P32298	578 aa		19.73	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	FLT3LG	P49771	235 aa		19.73	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPARA	Q07869	468 aa		19.73	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		19.73	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	VCPKMT	Q9H867	229 aa		19.73	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	GOPC	Q9HD26	462 aa		19.73	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		19.73	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		19.73	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYH8	P13535	1937 aa		19.72	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		19.72	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0D9SFI3	127 aa		19.72	■□□□□ 0.75
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRDM1	O75626	825 aa		19.72	■□□□□ 0.75

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