RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 ADGRA2Q96PE1 1338 aa33.68■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 AKR1B1P15121 316 aa33.67■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 USP17L2Q6R6M4 530 aa33.67■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 TMEM179Q6ZVK1 233 aa33.67■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 PNMA3Q9UL41 463 aa33.67■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 ACER1Q8TDN7 264 aa33.66■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa33.65■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 EMILIN3Q9NT22 766 aa33.65■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 PTPN22Q9Y2R2 807 aa33.65■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 OSBPP22059 807 aa33.64■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 TTC22Q5TAA0 569 aa33.64■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 VPS53Q5VIR6 699 aa33.64■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa33.64■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 EFCC1Q9HA90 598 aa33.64■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 MKNK2Q9HBH9 465 aa33.64■■■□□ 2.98
NOMO3-217ENST00000576589 ROBO3Q96MS0 1386 aa33.63■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 FOXP2O15409 715 aa33.63■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 USP14P54578 494 aa33.63■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 CAP1Q01518 475 aa33.63■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 KIF22Q14807 665 aa33.63■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 BCRP11274 1271 aa33.62■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 ARHGEF6Q15052 776 aa33.62■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa33.62■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 PTPRFP10586 1907 aa33.61■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 HTTP42858 3142 aa33.61■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 C12orf42Q96LP6 360 aa33.61■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 HIP1O00291 1037 aa33.6■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 PPARAQ07869 468 aa33.6■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF287Q9HBT7 754 aa33.6■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC171Q6TFL3 1326 aa33.59■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 A0A1W2PRG0 241 aa33.59■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 RASA1P20936 1047 aa33.59■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 ICA1Q05084 483 aa33.59■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 CLEC10AQ8IUN9 316 aa33.59■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa33.59■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa33.58■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 LOC285556D6RIA3 1793 aa33.57■■■□□ 2.97
NOMO3-217ENST00000576589 NEFLP07196 543 aa33.57■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 ALX1Q15699 326 aa33.57■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 SIAH1Q8IUQ4 282 aa33.57■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 KANSL2Q9H9L4 492 aa33.57■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 POTEFA5A3E0 1075 aa33.56■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 PRDM1O75626 825 aa33.56■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP33.56■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 PDE4BQ07343 736 aa33.56■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa33.56■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 VCAM1P19320 739 aa33.55■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 PSMC4P43686 418 aa33.55■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 ARMC5Q96C12 935 aa33.55■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP33.55■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 FGAP02671 866 aa33.54■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 ATP2B2Q01814 1243 aa33.54■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 SH2D4AQ9H788 454 aa33.54■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 TMX2Q9Y320 296 aa33.54■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 USP17L15C9J2P7 530 aa33.53■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 USP17L13C9JLJ4 530 aa33.53■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 USP17L11C9JVI0 530 aa33.53■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 USP17L18D6R9N7 530 aa33.53■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 USP17L22D6RA61 530 aa33.53■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 USP17L17D6RBQ6 530 aa33.53■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 USP17L19D6RCP7 530 aa33.53■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 USP17L20D6RJB6 530 aa33.53■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 EEF2P13639 858 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 CTGFP29279 349 aa33.53■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 USP17L24Q0WX57 530 aa33.53■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP33.52■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 HERVK_113P62684 666 aa33.52■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 CTDSPL2Q05D32 466 aa33.52■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 FAM110CQ1W6H9 321 aa33.52■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC136Q96JN2 1154 aa33.52■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 TRIM47Q96LD4 638 aa33.52■■■□□ 2.96
NOMO3-217ENST00000576589 GNRH1P01148 92 aa33.51■■■□□ 2.95
NOMO3-217ENST00000576589 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
NOMO3-217ENST00000576589 ANAPC4Q9UJX5 808 aa33.51■■■□□ 2.95
NOMO3-217ENST00000576589 FCGRTP55899 365 aa33.5■■■□□ 2.95
NOMO3-217ENST00000576589 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa33.5■■■□□ 2.95
NOMO3-217ENST00000576589 VCPKMTQ9H867 229 aa33.49■■■□□ 2.95
NOMO3-217ENST00000576589 ZMYM6O95789 1325 aa33.49■■■□□ 2.95
NOMO3-217ENST00000576589 CENPFP49454 3210 aa33.48■■■□□ 2.95
NOMO3-217ENST00000576589 HOXD10P28358 340 aa33.48■■■□□ 2.95
NOMO3-217ENST00000576589 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms