RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561112.1

RASGRF1-208, Transcript of Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1, human

TSL 2

Gene RASGRF1, Length 265 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASGRF1-208	ENST00000561112	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	PEX10	O60683	326 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	RASA1	P20936	1047 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	TDO2	P48775	406 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RASGRF1-208	ENST00000561112	PRDM1	O75626	825 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	IL25	Q9H293	177 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	MYH8	P13535	1937 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	FGA	P02671	866 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	PPARA	Q07869	468 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	NAPB	Q9H115	298 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	VCAM1	P19320	739 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	OSBP	P22059	807 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	PSMC4	P43686	418 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	ALX1	Q15699	326 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	USP14	P54578	494 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	HERVK_113	P62684	666 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	ICA1	Q05084	483 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112		Q3C1V9	767 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	FEZ1	Q99689	392 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.86	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	CNMD	O75829	334 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	KIF22	Q14807	665 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	FGR	P09769	529 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	MGAM	O43451	1857 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RASGRF1-208	ENST00000561112	RLF	Q13129	1914 aa		13.84	□□□□□ -0.19

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