RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556687.5

RBM23-222, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 2

Gene RBM23, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-222	ENST00000556687	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	HOXD10	P28358	340 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	CDK8	P49336	464 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	PRMT2	P55345	433 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	FCGRT	P55899	365 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	SMC5	Q8IY18	1101 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	ZNF333	Q96JL9	665 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	STAP2	Q9UGK3	403 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	SWAP70	Q9UH65	585 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RBM23-222	ENST00000556687	MYPN	Q86TC9	1320 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687		A0A1W2PRG0	241 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	GPAA1	O43292	621 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	AKR1B1	P15121	316 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	PDE1A	P54750	535 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	PRKCZ	Q05513	592 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	FEZ1	Q99689	392 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	FSD1	Q9BTV5	496 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	LNPK	Q9C0E8	428 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	HERVK_113	P62684	666 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	NBPF11	Q86T75	865 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	RAET1E	Q8TD07	263 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	C12orf42	Q96LP6	360 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	FLT3LG	P49771	235 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	USP14	P54578	494 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	SBK1	Q52WX2	424 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	USP17L15	C9J2P7	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	USP17L11	C9JVI0	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	USP17L18	D6R9N7	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	USP17L22	D6RA61	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	USP17L19	D6RCP7	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	USP17L20	D6RJB6	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	APP	P05067	770 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	VCAM1	P19320	739 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	GRK4	P32298	578 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	USP17L24	Q0WX57	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	MTFR1	Q15390	333 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687		Q3C1V9	767 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	POTEH	Q6S545	545 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	GNAT2	P19087	354 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	COA7	Q96BR5	231 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	EVI5L	Q96CN4	794 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	CCDC17	Q96LX7	622 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	ADCY3	O60266	1144 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	ELN	P15502	786 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	TDO2	P48775	406 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	NUCB1	Q02818	461 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	GJD2	Q9UKL4	321 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RBM23-222	ENST00000556687	CNMD	O75829	334 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	RASA1	P20936	1047 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	ERVK-9	P63128	1117 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	ERVK-24	P63145	666 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	ICA1	Q05084	483 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RBM23-222	ENST00000556687	PORCN	Q9H237	461 aa		14.64	□□□□□ -0.07

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms