RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554811.5

XRCC3-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, human

TSL 2

Gene XRCC3, Length 3,668 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XRCC3-208	ENST00000554811	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	ZMYND10	O75800	440 aa		13.45	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	CSF1R	P07333	972 aa		13.45	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	STAT6	P42226	847 aa		13.45	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.45	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	KIAA1328	Q86T90	577 aa		13.45	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		13.45	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	PP2D1	A8MPX8	630 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	WNT7A	O00755	349 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	VPS18	Q9P253	973 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	KIF20A	O95235	890 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	PTPRE	P23469	700 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	KRT9	P35527	623 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	GOLGA1	Q92805	767 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	UBA7	P41226	1012 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	C5	P01031	1676 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811		A0A087X0B3	334 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	SLC35F6	Q8N357	371 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	TC2N	Q8N9U0	490 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	TIGD1	Q96MW7	591 aa		13.43	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	IDE	P14735	1019 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	GPS2	Q13227	327 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	PAGE5	Q96GU1	130 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	KLRK1	P26718	216 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	LIFR	P42702	1097 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	PLCD1	P51178	756 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	CUL4B	Q13620	913 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	DDB1	Q16531	1140 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	ST5	P78524	1137 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	TMTC2	Q8N394	836 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	NELFB	Q8WX92	580 aa		13.42	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	PRDX5	P30044	214 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	CTAGE9	A4FU28	777 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	ABL1	P00519	1130 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	INF2	Q27J81	1249 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	LETM2	Q2VYF4	491 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.41	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	KCNQ2	O43526	872 aa		13.4	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	GNAT2	P19087	354 aa		13.4	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
XRCC3-208	ENST00000554811	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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