RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 TRIM47Q96LD4 638 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 DCTPP1Q9H773 170 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 RAI14Q9P0K7 980 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 LRP2BPQ9P2M1 347 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 SRRDQ9UH36 339 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 ALPK3Q96L96 1907 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 CETPP11597 493 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 OSBPP22059 807 aa11.74□□□□□ -0.53
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CS-217ENST00000550044 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 LRRCC1Q9C099 1032 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 USP40Q9NVE5 1235 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 CPA4Q9UI42 421 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 MYPNQ86TC9 1320 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 VCANP13611 3396 aa11.74□□□□□ -0.53
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CS-217ENST00000550044 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 UBXN2AP68543 259 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 TEPSINQ96N21 525 aa11.73□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 TMEM39BQ9GZU3 492 aa11.73□□□□□ -0.53
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CS-217ENST00000550044 TNNI2P48788 182 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 TCP10Q12799 353 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 ZNF384Q8TF68 577 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 ANTXR1Q9H6X2 564 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 MYH13Q9UKX3 1938 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 MGAMO43451 1857 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 IRF6O14896 467 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 LDHCP07864 332 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 BTDP43251 543 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 PRKCZQ05513 592 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 SNAPC2Q13487 334 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 C17orf99Q6UX52 265 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 SLF2Q8IX21 1173 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 BOLA2Q9H3K6 86 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-217ENST00000550044 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 IDH1O75874 414 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 SGPL1O95470 568 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 GSTO1P78417 241 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 NFIAQ12857 509 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ERO1BQ86YB8 467 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ZFPM1Q8IX07 1006 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ZNF516Q92618 1163 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 WRNIP1Q96S55 665 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 MTMR10Q9NXD2 777 aa11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 GAKO14976 1311 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 MAP3K7O43318 606 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 TFRCP02786 760 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 PPIL2Q13356 520 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ANKRD45Q5TZF3 282 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 C7orf61Q8IZ16 206 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 DDX12PQ92771 950 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 GDF15Q99988 308 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.69□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ADGRA2Q96PE1 1338 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 PDHXO00330 501 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 GOLIM4O00461 696 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 IGHDP01880 384 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ATP5JP18859 108 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 CYP7A1P22680 504 aa11.68□□□□□ -0.54
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CS-217ENST00000550044 AAMPQ13685 434 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 TSHZ3Q63HK5 1081 aa11.68□□□□□ -0.54
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CS-217ENST00000550044 FAM83AQ86UY5 434 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 MAGEB6Q8N7X4 407 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 FAM151AQ8WW52 585 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 DEFB118Q96PH6 123 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 GABRQQ9UN88 632 aa11.68□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 EYSQ5T1H1 3165 aa11.68□□□□□ -0.54
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