RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547217.5

PACS2-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PACS2, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-205ENST00000547217 PNMA1Q8ND90 353 aa20.11■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.11■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.811e-6■■■□□ 18.6
PACS2-205ENST00000547217 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.11■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 YDJCA8MPS7 323 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 FOCADQ5VW36 1801 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 NR5A1Q13285 461 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 ANO1Q5XXA6 986 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 OXER1Q8TDS5 423 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 POLR3EQ9NVU0 708 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 RGS22Q8NE09 1264 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.08■□□□□ 0.81
PACS2-205ENST00000547217 SPTLC2O15270 562 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 TCP10Q12799 353 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 ANKS1AQ92625 1134 aa20.08■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 TNMDQ9H2S6 317 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 YEATS4O95619 227 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 CEP95Q96GE4 821 aa20.07■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 A0A1B0GVL5 298 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 GABPAQ06546 454 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 CCDC93Q567U6 631 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 FSIP1Q8NA03 581 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.06■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 ADALQ6DHV7 355 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 MAP3K14Q99558 947 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 ATP2B1P20020 1258 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 KIF5BP33176 963 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 MAP3K11Q16584 847 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 CPVLQ9H3G5 476 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 CLSTN2Q9H4D0 955 aa20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 RAD17O75943 681 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 AKR1B1P15121 316 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 SLC39A14Q15043 492 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 FAM205CA6NFA0 338 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 EIF6P56537 245 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 PTPAQ15257 358 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 PHF20Q9BVI0 1012 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 CABP5Q9NP86 173 aa20.04■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 FAM196BA6NMK8 535 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 GRM4Q14833 912 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 XBP1P17861 261 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 NT5C2P49902 561 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 ADAMTS3O15072 1205 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 NDUFA8P51970 172 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.03■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 CYTH3O43739 400 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 MRIQ9BWK5 157 aa20.02■□□□□ 0.8
PACS2-205ENST00000547217 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
PACS2-205ENST00000547217 SCG2P13521 617 aa20.02■□□□□ 0.79
PACS2-205ENST00000547217 SHMT1P34896 483 aa20.02■□□□□ 0.79
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