RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542019.1

TM7SF3-210, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-210ENST00000542019 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa29.76■■■□□ 2.35
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TM7SF3-210ENST00000542019 TDO2P48775 406 aa29.76■■■□□ 2.35
TM7SF3-210ENST00000542019 IFNL3Q8IZI9 196 aa29.76■■■□□ 2.35
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM227BQ96M60 508 aa29.76■■■□□ 2.35
TM7SF3-210ENST00000542019 A0A1W2PRG0 241 aa29.75■■■□□ 2.35
TM7SF3-210ENST00000542019 USP17L2Q6R6M4 530 aa29.75■■■□□ 2.35
TM7SF3-210ENST00000542019 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa29.75■■■□□ 2.35
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TM7SF3-210ENST00000542019 TRIM47Q96LD4 638 aa29.75■■■□□ 2.35
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TM7SF3-210ENST00000542019 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29.74■■■□□ 2.35
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TM7SF3-210ENST00000542019 TAOK2Q9UL54 1235 aa29.74■■■□□ 2.35
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TM7SF3-210ENST00000542019 C12orf42Q96LP6 360 aa29.73■■■□□ 2.35
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TM7SF3-210ENST00000542019 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.35
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TM7SF3-210ENST00000542019 SOX10P56693 466 aa29.69■■■□□ 2.34
TM7SF3-210ENST00000542019 ARHGEF6Q15052 776 aa29.69■■■□□ 2.34
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TM7SF3-210ENST00000542019 FAM110CQ1W6H9 321 aa29.68■■■□□ 2.34
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TM7SF3-210ENST00000542019 HERVK_113P62684 666 aa29.67■■■□□ 2.34
TM7SF3-210ENST00000542019 TXNRD2Q9NNW7 524 aa29.67■■■□□ 2.34
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TM7SF3-210ENST00000542019 USP17L11C9JVI0 530 aa29.64■■■□□ 2.34
TM7SF3-210ENST00000542019 USP17L18D6R9N7 530 aa29.64■■■□□ 2.34
TM7SF3-210ENST00000542019 USP17L22D6RA61 530 aa29.64■■■□□ 2.34
TM7SF3-210ENST00000542019 USP17L17D6RBQ6 530 aa29.64■■■□□ 2.34
TM7SF3-210ENST00000542019 USP17L19D6RCP7 530 aa29.64■■■□□ 2.34
TM7SF3-210ENST00000542019 USP17L20D6RJB6 530 aa29.64■■■□□ 2.34
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TM7SF3-210ENST00000542019 USP17L24Q0WX57 530 aa29.64■■■□□ 2.34
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TM7SF3-210ENST00000542019 MORF4L1Q9UBU8 362 aa29.64■■■□□ 2.34
TM7SF3-210ENST00000542019 TMX2Q9Y320 296 aa29.64■■■□□ 2.34
TM7SF3-210ENST00000542019 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.64■■■□□ 2.34
TM7SF3-210ENST00000542019 MYPNQ86TC9 1320 aa29.64■■■□□ 2.34
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TM7SF3-210ENST00000542019 CNMDO75829 334 aa29.6■■■□□ 2.33
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TM7SF3-210ENST00000542019 HOXD10P28358 340 aa29.6■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 PRMT2P55345 433 aa29.6■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 Q3C1V9 767 aa29.6■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa29.6■■■□□ 2.33
TM7SF3-210ENST00000542019 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
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