RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 CENPFP49454 3210 aa22.49■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 A0A0D9SFI3 127 aa22.49■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.49■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 OSBPP22059 807 aa22.49■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 KIF22Q14807 665 aa22.49■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.49■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 EVI5LQ96CN4 794 aa22.49■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 SWAP70Q9UH65 585 aa22.49■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 C19orf81C9J6K1 198 aa22.48■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 APPP05067 770 aa22.48■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 TDO2P48775 406 aa22.48■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 VPS53Q5VIR6 699 aa22.48■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.48■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.48■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.48■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 SBK1Q52WX2 424 aa22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 PNMA3Q9UL41 463 aa22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 GABRQQ9UN88 632 aa22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.47■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 PLXNB2O15031 1838 aa22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 VCAM1P19320 739 aa22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 PRKCZQ05513 592 aa22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 RILPL2Q969X0 211 aa22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 C12orf42Q96LP6 360 aa22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 RLFQ13129 1914 aa22.46■■□□□ 1.19
TSTA3-211ENST00000529899 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 PRDM1O75626 825 aa22.45■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 RASA1P20936 1047 aa22.45■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 SRRDQ9UH36 339 aa22.45■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 MYPNQ86TC9 1320 aa22.45■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 PARP14Q460N5 1801 aa22.45■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 GNAT2P19087 354 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 HERVK_113P62684 666 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 ICA1Q05084 483 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.181e-12■■□□□ 12
TSTA3-211ENST00000529899 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.44■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 FCGRTP55899 365 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 ARMC5Q96C12 935 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 INCENPQ9NQS7 918 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 MYH4Q9Y623 1939 aa22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 POTEFA5A3E0 1075 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 ATP2B2Q01814 1243 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 ARHGEF6Q15052 776 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.42■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 CNMDO75829 334 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 USP14P54578 494 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 Q3C1V9 767 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF333Q96JL9 665 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC17Q96LX7 622 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 NAPBQ9H115 298 aa22.41■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 RGS19P49795 217 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 PPARAQ07869 468 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.4■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TSTA3-211ENST00000529899 USP17L15C9J2P7 530 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 USP17L11C9JVI0 530 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 USP17L18D6R9N7 530 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 USP17L22D6RA61 530 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 USP17L19D6RCP7 530 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 USP17L20D6RJB6 530 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 SDSP20132 328 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 FLT3LGP49771 235 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 USP17L24Q0WX57 530 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 SKAP1Q86WV1 359 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 RAET1EQ8TD07 263 aa22.39■■□□□ 1.17
TSTA3-211ENST00000529899 PORCNQ9H237 461 aa22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms