RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.73■■□□□ 1.87
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TSNARE1-208ENST00000524325 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.72■■□□□ 1.87
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TSNARE1-208ENST00000524325 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.72■■□□□ 1.87
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TSNARE1-208ENST00000524325 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
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TSNARE1-208ENST00000524325 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.71■■□□□ 1.87
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF654Q8IZM8 581 aa26.64■■□□□ 1.85
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TSNARE1-208ENST00000524325 PPFIA3O75145 1194 aa26.62■■□□□ 1.85
TSNARE1-208ENST00000524325 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.62■■□□□ 1.85
TSNARE1-208ENST00000524325 HUNKP57058 714 aa26.61■■□□□ 1.85
TSNARE1-208ENST00000524325 TMTC2Q8N394 836 aa26.61■■□□□ 1.85
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