RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 JAK2O60674 1132 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 ADAMTS2O95450 1211 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 CSF1RP07333 972 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 ITGA6P23229 1130 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 GNG11P61952 73 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 VSNL1P62760 191 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 BCAS4Q8TDM0 211 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 LRP6O75581 1613 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 SHTN1A0MZ66 631 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 PDCP20941 246 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 METTL24Q5JXM2 366 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 CEP57L1Q8IYX8 460 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 C3orf20Q8ND61 904 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 SPDL1Q96EA4 605 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa9.56□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 NUP98P52948 1817 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 MYH3P11055 1940 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 FRMD3A2A2Y4 597 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 ARHGAP25P42331 645 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 WASHC4Q2M389 1173 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 KIAA1328Q86T90 577 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 OSBP2Q969R2 916 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 VCPKMTQ9H867 229 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 SPEF2Q9C093 1822 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 CTSWP56202 376 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 FAM228AQ86W67 206 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM139Q8IV31 216 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 MKL1Q969V6 931 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 CRACR2AQ9BSW2 395 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 IFNKQ9P0W0 207 aa9.55□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 ZAP70P43403 619 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 KCNB1Q14721 858 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 NAA25Q14CX7 972 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 ARMC3Q5W041 872 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 CHST3Q7LGC8 479 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 E7EWF7 191 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 ARHGAP6O43182 974 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 PPFIA1Q13136 1202 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 FILIP1LQ4L180 1135 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 WDR93Q6P2C0 686 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.54□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 IMPDH2P12268 514 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 PPFIA3O75145 1194 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 KIAA0754O94854 1291 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 PYGLP06737 847 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 PEX19P40855 299 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 HAND2P61296 217 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 SETDB1Q15047 1291 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 SNCBQ16143 134 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 MYO6Q9UM54 1294 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 FESP07332 822 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 ABCD1P33897 745 aa9.53□□□□□ -0.88
TRPS1-209ENST00000519674 MCAMP43121 646 aa9.53□□□□□ -0.88
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