RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 UBOX5O94941 541 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ASPAP45381 313 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 MTERF2Q49AM1 385 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 TAF7LQ5H9L4 462 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 LILRB2Q8N423 598 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 FBXL18Q96ME1 805 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC26A8Q96RN1 970 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 FBRSQ9HAH7 460 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 KLHL3Q9UH77 587 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 AP4E1Q9UPM8 1137 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 CSADQ9Y600 493 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANKRD34BA5PLL1 514 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANKRD62A6NC57 917 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 SUSD5O60279 629 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 CHMP4BP1P59074 171 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 RNF4P78317 190 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAP7Q14244 749 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADGRE1Q14246 886 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 NKG7Q16617 165 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 DYMQ7RTS9 669 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 PHACTR4Q8IZ21 702 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 VWCEQ96DN2 955 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 ST7Q9NRC1 585 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM105AQ9NUU6 356 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 CEP131Q9UPN4 1083 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-390P-201ENST00000516259 CDC45O75419 566 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 CLEC3AO75596 197 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 APBA3O96018 575 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 CAPNS1P04632 268 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 GBP1P32455 592 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 ETV3P41162 512 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC10A6Q3KNW5 377 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 GNPTABQ3T906 1256 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIAA1211LQ6NV74 962 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM192Q8IY95 271 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 DNAJB8Q8NHS0 232 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 MYRFLQ96LU7 910 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC6A18Q96N87 628 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 FEZ1Q99689 392 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 SPATA9Q9BWV2 254 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 ASPNQ9BXN1 380 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRBA1A5PL33 1030 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 AGRPO00253 132 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 SART1O43290 800 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 DRD2P14416 443 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 PREPP48147 710 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 SQSTM1Q13501 440 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 TCEA2Q15560 299 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 GIMAP7Q8NHV1 300 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 RNF141Q8WVD5 230 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 WFDC12Q8WWY7 111 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIF2CQ99661 725 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 APBA2Q99767 749 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 KLHL25Q9H0H3 589 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 SEMA6CQ9H3T2 930 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 SUSD2Q9UGT4 822 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 PLAAQ9Y263 795 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 KDM2BQ8NHM5 1336 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADCY3O60266 1144 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 RFPL3O75679 317 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 CYP7A1P22680 504 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 NOS3P29474 1203 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 USP11P51784 963 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 MBTPS1Q14703 1052 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 GRIK4Q16099 956 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 HAUS7Q99871 368 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 GBP3Q9H0R5 595 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 FANCLQ9NW38 375 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-390P-201ENST00000516259 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms