RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 PF4P02776 101 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 GARTP22102 1010 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 CDH24Q86UP0 819 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 XAGE3Q8WTP9 111 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 FAM168AQ92567 244 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM74Q96NL1 305 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 KIR3DL1P43629 444 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 PDE4BQ07343 736 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 TNK2Q07912 1038 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 THAP5Q7Z6K1 395 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 F6X3S4 739 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 F13A1P00488 732 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 Q96M66 194 aa8.23□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 KCNQ5Q9NR82 932 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.21□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.21□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 H3BS24 57 aa8.21□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 CBX7O95931 251 aa8.21□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 CYP7A1P22680 504 aa8.21□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.21□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.21□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 SRFP11831 508 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 PLCG1P19174 1290 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF124Q15973 351 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 RELL1Q8IUW5 271 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.2□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 ESR1P03372 595 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 ETV3P41162 512 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 PWP1Q13610 501 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 PKN1Q16512 942 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 FYB2Q5VWT5 728 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 KSR1Q8IVT5 923 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 UBE2FQ969M7 185 aa8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.18□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 GAB4Q2WGN9 574 aa8.18□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 MRS2Q9HD23 443 aa8.18□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 COPRSQ9NQ92 184 aa8.18□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 IFT140Q96RY7 1462 aa8.18□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 GREM1O60565 184 aa8.17□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 DNAJA2O60884 412 aa8.17□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 GDNFP39905 211 aa8.17□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 JAG1P78504 1218 aa8.17□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 MPP2Q14168 576 aa8.17□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 FAM196AQ6ZSG2 479 aa8.17□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 SLC38A3Q99624 504 aa8.17□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC3Q9BY71 257 aa8.17□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.17□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.17□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.17□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 WASH4PA8MWX3 477 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 HTR3BO95264 441 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 BPNT1O95861 308 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 MESP2Q0VG99 397 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 KCNMB1Q16558 191 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 REC114Q7Z4M0 266 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 FAM13CQ8NE31 585 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 FBXO27Q8NI29 283 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 VWCEQ96DN2 955 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.16□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.15□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.15□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 MINDY4BA8MYZ0 360 aa8.15□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 ITGAEP38570 1179 aa8.15□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 AFMP43652 599 aa8.15□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PDE4D-217ENST00000509355 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.15□□□□□ -1.1
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