RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498183.5

GRAMD1C-215, Transcript of GRAM domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene GRAMD1C, Length 735 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
GRAMD1C-215ENST00000498183 ATP2B2Q01814 1243 aa26.14■■□□□ 1.78
GRAMD1C-215ENST00000498183 RGMBQ6NW40 437 aa26.14■■□□□ 1.78
GRAMD1C-215ENST00000498183 ERO1BQ86YB8 467 aa26.14■■□□□ 1.78
GRAMD1C-215ENST00000498183 ACER1Q8TDN7 264 aa26.14■■□□□ 1.78
GRAMD1C-215ENST00000498183 OTUD5Q96G74 571 aa26.14■■□□□ 1.78
GRAMD1C-215ENST00000498183 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.14■■□□□ 1.78
GRAMD1C-215ENST00000498183 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
GRAMD1C-215ENST00000498183 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.14■■□□□ 1.78
GRAMD1C-215ENST00000498183 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.14■■□□□ 1.78
GRAMD1C-215ENST00000498183 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 PSMA5P28066 241 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 MCM5P33992 734 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 ICA1Q05084 483 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 IL17RAQ96F46 866 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 WNK4Q96J92 1243 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 KIF2CQ99661 725 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 PHIPQ8WWQ0 1821 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 A0A1W2PRG0 241 aa26.12■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 ECE1P42892 770 aa26.12■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 RASAL3Q86YV0 1011 aa26.12■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.12■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.12■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa26.12■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 RPS6KB1P23443 525 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 NT5C2P49902 561 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 PPATQ06203 517 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 SPP2Q13103 211 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 IQCA1Q86XH1 822 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 WDR18Q9BV38 432 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 SENP2Q9HC62 589 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 TNKSO95271 1327 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 SEC23AQ15436 765 aa26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 CYP4F22Q6NT55 531 aa26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 AS3MTQ9HBK9 375 aa26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 NYAP2Q9P242 653 aa26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 STX8Q9UNK0 236 aa26.1■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 TRIM75PA6NK02 468 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 IRF6O14896 467 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 NOVP48745 357 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 PPIL2Q13356 520 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 DGKZQ13574 1117 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 TMEM67Q5HYA8 995 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 SPRYD7Q5W111 196 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 RUFY3Q7L099 469 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 RASSF10A6NK89 507 aa26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 TTLL1O95922 423 aa26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 SLC10A3P09131 477 aa26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 GRM1Q13255 1194 aa26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 HHIPL1Q96JK4 782 aa26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 TMEM47Q9BQJ4 181 aa26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1C-215ENST00000498183 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 HSPA6P17066 643 aa26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 USP17L10C9JJH3 530 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 MTMR2Q13614 643 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 WTAPQ15007 396 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 Q6ZUG5 572 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 DGKHQ86XP1 1220 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 ANKS1AQ92625 1134 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 MKL1Q969V6 931 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 TMEM87BQ96K49 555 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 TTC14Q96N46 770 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 FEZ1Q99689 392 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 LY9Q9HBG7 655 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 TMX2Q9Y320 296 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 WDR19Q8NEZ3 1342 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 MYH4Q9Y623 1939 aa26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 ERICH2A1L162 156 aa26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 BACE1P56817 501 aa26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 CXCL11O14625 94 aa26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1C-215ENST00000498183 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms