RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.73	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		6.73	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	KLK14	Q9P0G3	267 aa		6.73	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	SEPT3	Q9UH03	358 aa		6.73	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		6.73	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	BCS1L	Q9Y276	419 aa		6.73	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	TJP1	Q07157	1748 aa		6.73	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	C2CD2L	O14523	706 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	SGSM2	O43147	1006 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAMTS2	O95450	1211 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	CSF1R	P07333	972 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	TNP2	Q05952	138 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	RTN1	Q16799	776 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	HSCB	Q8IWL3	235 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	CNTROB	Q8N137	903 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNB2	Q92953	911 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	GPATCH3	Q96I76	525 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	RAD50	Q92878	1312 aa		6.72	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		6.71	□□□□□ -1.33
ATG4A-208	ENST00000489247	HIP1	O00291	1037 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ABL1	P00519	1130 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP5J	P18859	108 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CD33	P20138	364 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	MX2	P20592	715 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	FGFR3	P22607	806 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	DGKZ	Q13574	1117 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	TNNI3K	Q59H18	835 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	AACS	Q86V21	672 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	NLRP10	Q86W26	655 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	EVI5L	Q96CN4	794 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		6.71	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	LRP5	O75197	1615 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	EYA2	O00167	538 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	EFS	O43281	561 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM157B	P0CG42	384 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	SIK1	P57059	783 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	COX20	Q5RI15	118 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	PHF24	Q9UPV7	400 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ITGB4	P16144	1822 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		6.7	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	RTL9	Q8NET4	1388 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	PALLD	Q8WX93	1383 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ABCC12	Q96J65	1359 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF609	O15014	1411 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	MCC	P23508	829 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPA4	P34932	840 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	MCM2	P49736	904 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	PIP4K2B	P78356	416 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	NFKBIB	Q15653	356 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	PARP10	Q53GL7	1025 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM26D	Q5JW98	314 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	MYO19	Q96H55	970 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CEP63	Q96MT8	703 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
ATG4A-208	ENST00000489247	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34

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