RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488787.5

GTPBP1-212, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTPBP1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-212ENST00000488787 CCDC178Q5BJE1 867 aa27.6■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa27.6■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 RASAL3Q86YV0 1011 aa27.6■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 SIAH1Q8IUQ4 282 aa27.6■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 CEP95Q96GE4 821 aa27.6■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 TM6SF1Q9BZW5 370 aa27.6■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 AS3MTQ9HBK9 375 aa27.6■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 MTMR4Q9NYA4 1195 aa27.6■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 NYAP2Q9P242 653 aa27.6■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa27.6■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 MCM5P33992 734 aa27.59■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 GJA5P36382 358 aa27.59■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 NOVP48745 357 aa27.59■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 DEFB115Q30KQ5 88 aa27.59■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 SPRYD7Q5W111 196 aa27.59■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 IQCA1Q86XH1 822 aa27.59■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 CCDC102AQ96A19 550 aa27.59■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 NMT2O60551 498 aa27.58■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 ANTXR2P58335 489 aa27.58■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 ICA1Q05084 483 aa27.58■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 ZNF280CQ8ND82 737 aa27.58■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 OTUD5Q96G74 571 aa27.58■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 MTA3Q9BTC8 594 aa27.58■■■□□ 2.01
GTPBP1-212ENST00000488787 CXCL11O14625 94 aa27.57■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 SLC10A3P09131 477 aa27.57■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
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GTPBP1-212ENST00000488787 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 CLEC10AQ8IUN9 316 aa27.57■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 ANKS1AQ92625 1134 aa27.57■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 MKL1Q969V6 931 aa27.57■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 TTC14Q96N46 770 aa27.57■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 KCNH4Q9UQ05 1017 aa27.57■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 TTLL1O95922 423 aa27.56■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 SPP2Q13103 211 aa27.56■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 DGKHQ86XP1 1220 aa27.56■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 ACER1Q8TDN7 264 aa27.56■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa27.56■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 UBAC1Q9BSL1 405 aa27.56■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa27.56■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.56■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 WDR19Q8NEZ3 1342 aa27.56■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 IRF6O14896 467 aa27.55■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 PRC1O43663 620 aa27.55■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 RCSD1Q6JBY9 416 aa27.55■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.55■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 CHST3Q7LGC8 479 aa27.55■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.55■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 CLIP2Q9UDT6 1046 aa27.55■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 TMX2Q9Y320 296 aa27.55■■■□□ 2
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GTPBP1-212ENST00000488787 HTRA3P83110 453 aa27.54■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa27.54■■■□□ 2
GTPBP1-212ENST00000488787 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa27.54■■■□□ 2
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GTPBP1-212ENST00000488787 TNKSO95271 1327 aa27.53■■■□□ 2
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GTPBP1-212ENST00000488787 USP17L10C9JJH3 530 aa27.53■■■□□ 2
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GTPBP1-212ENST00000488787 ATP2B2Q01814 1243 aa27.53■■■□□ 2
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GTPBP1-212ENST00000488787 SH2D4AQ9H788 454 aa27.53■■■□□ 2
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GTPBP1-212ENST00000488787 RUFY3Q7L099 469 aa27.52■■■□□ 2
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GTPBP1-212ENST00000488787 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa27.52■■■□□ 2
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GTPBP1-212ENST00000488787 MYH4Q9Y623 1939 aa27.51■■□□□ 1.99
GTPBP1-212ENST00000488787 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
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GTPBP1-212ENST00000488787 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
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GTPBP1-212ENST00000488787 USP17L2Q6R6M4 530 aa27.5■■□□□ 1.99
GTPBP1-212ENST00000488787 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
GTPBP1-212ENST00000488787 MS4A4AQ96JQ5 239 aa27.5■■□□□ 1.99
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