RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488270.1

HDAC10-215, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC10, Length 715 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-215ENST00000488270 PNMA3Q9UL41 463 aa22.69■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 ARHGEF6Q15052 776 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 CCDC17Q96LX7 622 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 FAM227BQ96M60 508 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 MYH7P12883 1935 aa22.68■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.68■■□□□ 1.22
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HDAC10-215ENST00000488270 OSBPP22059 807 aa22.67■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 KIF22Q14807 665 aa22.67■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.67■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.67■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.66■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.66■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 APPP05067 770 aa22.66■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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HDAC10-215ENST00000488270 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.66■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.66■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.66■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.66■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 A0A0D9SFI3 127 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 PEX10O60683 326 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 USP14P54578 494 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 VPS53Q5VIR6 699 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 FEZ1Q99689 392 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 SRRDQ9UH36 339 aa22.65■■□□□ 1.22
HDAC10-215ENST00000488270 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 VCAM1P19320 739 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 RASA1P20936 1047 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 TDO2P48775 406 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 HERVK_113P62684 666 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 ARMC5Q96C12 935 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.64■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 SDSP20132 328 aa22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 PRMT2P55345 433 aa22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 RILPL2Q969X0 211 aa22.63■■□□□ 1.21
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HDAC10-215ENST00000488270 TMX2Q9Y320 296 aa22.63■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 USP17L15C9J2P7 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 USP17L11C9JVI0 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 USP17L18D6R9N7 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 USP17L22D6RA61 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 USP17L19D6RCP7 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 USP17L20D6RJB6 530 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 FCGRTP55899 365 aa22.62■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 USP17L24Q0WX57 530 aa22.62■■□□□ 1.21
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HDAC10-215ENST00000488270 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.61■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 SOX10P56693 466 aa22.61■■□□□ 1.21
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HDAC10-215ENST00000488270 ALX1Q15699 326 aa22.61■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 Q3C1V9 767 aa22.61■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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HDAC10-215ENST00000488270 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.61■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.61■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 GABRQQ9UN88 632 aa22.61■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.61■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.6■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 PRDM1O75626 825 aa22.6■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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HDAC10-215ENST00000488270 PRKCZQ05513 592 aa22.6■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
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HDAC10-215ENST00000488270 ZNF333Q96JL9 665 aa22.59■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 CNMDO75829 334 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 FGAP02671 866 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 LBX2Q6XYB7 198 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 VCPKMTQ9H867 229 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 INCENPQ9NQS7 918 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 GJD2Q9UKL4 321 aa22.58■■□□□ 1.21
HDAC10-215ENST00000488270 MYPNQ86TC9 1320 aa22.57■■□□□ 1.2
HDAC10-215ENST00000488270 FLT3LGP49771 235 aa22.57■■□□□ 1.2
HDAC10-215ENST00000488270 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.57■■□□□ 1.2
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