RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481269.1

CSNK2B-208, Transcript of casein kinase 2 beta, human

TSL 2

Gene CSNK2B, Length 785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2B-208	ENST00000481269	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	RFXAP	O00287	272 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	PTPRA	P18433	802 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	TMEM240	Q5SV17	173 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	IER5L	Q5T953	404 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	APBA2	Q99767	749 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	SIL1	Q9H173	461 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	REV3L	O60673	3130 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	SLC5A1	P13866	664 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	CHRND	Q07001	517 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	GORAB	Q5T7V8	394 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	KRT40	Q6A162	431 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	PRRX2	Q99811	253 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	TAF5L	O75529	589 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	TCF15	Q12870	199 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.78	□□□□□ -0.2	2e-11	■■■□□ 15.1
CSNK2B-208	ENST00000481269	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	POLA2	Q14181	598 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	RASIP1	Q5U651	963 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CSNK2B-208	ENST00000481269	APBB1	O00213	710 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	PDE8B	O95263	885 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21	5e-32	■□□□□ 8.6
CSNK2B-208	ENST00000481269	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	USP6NL	Q92738	828 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	PEX10	O60683	326 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	ACR	P10323	421 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	MAPK4	P31152	587 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	RABGGTB	P53611	331 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	TCP10	Q12799	353 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	CERS4	Q9HA82	394 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	LPIN2	Q92539	896 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	ATRX	P46100	2492 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	PLXNB2	O15031	1838 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	TIMP1	P01033	207 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	MYOG	P15173	224 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	IL9	P15248	144 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	GRIK5	Q16478	980 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	MORN1	Q5T089	497 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	GPR142	Q7Z601	462 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CSNK2B-208	ENST00000481269	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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