RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479495.5

QARS-215, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 4

Gene QARS, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-215	ENST00000479495	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	ASB2	Q96Q27	587 aa		11.12	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.12	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		11.12	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	HOXC6	P09630	235 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	CYBA	P13498	195 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	RAG1	P15918	1043 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	SNX17	Q15036	470 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	DPP9	Q86TI2	863 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	TRPV1	Q8NER1	839 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	FERMT2	Q96AC1	680 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	GINM1	Q9NU53	330 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		11.11	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	USP17L15	C9J2P7	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	USP17L11	C9JVI0	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	USP17L18	D6R9N7	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	USP17L22	D6RA61	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	USP17L19	D6RCP7	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	USP17L20	D6RJB6	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	CNMD	O75829	334 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	GDF11	O95390	407 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	CLTB	P09497	229 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	TIMM10	P62072	90 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	JAG1	P78504	1218 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	TLE2	Q04725	743 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	USP17L24	Q0WX57	530 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	GRB14	Q14449	540 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	ZNF384	Q8TF68	577 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	TIFA	Q96CG3	184 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	RAI14	Q9P0K7	980 aa		11.1	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		11.09	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	SEPT4	O43236	478 aa		11.09	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	ITGB8	P26012	769 aa		11.09	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	EPHB4	P54760	987 aa		11.09	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	FPGS	Q05932	587 aa		11.09	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	LRRC41	Q15345	812 aa		11.09	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.09	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.09	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		11.09	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	PTPRC	P08575	1304 aa		11.09	□□□□□ -0.63
QARS-215	ENST00000479495	MYH1	P12882	1939 aa		11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	FEZ1	Q99689	392 aa		11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	DNAJC18	Q9H819	358 aa		11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	NCOR1	O75376	2440 aa		11.08	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495		A0A1B0GUL7	405 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	KIAA0355	O15063	1070 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	BAG3	O95817	575 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	IGFBP4	P22692	258 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	ADORA2A	P29274	412 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	USP14	P54578	494 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	C12orf42	Q96LP6	360 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	BTBD7	Q9P203	1132 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		11.07	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	GBF1	Q92538	1859 aa		11.06	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	STRN	O43815	780 aa		11.06	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	HLA-DOA	P06340	250 aa		11.06	□□□□□ -0.64
QARS-215	ENST00000479495	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms