RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 BCRP11274 1271 aa23.78■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 AKR1B1P15121 316 aa23.78■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 OSBPP22059 807 aa23.78■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 CAP1Q01518 475 aa23.78■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 ACER1Q8TDN7 264 aa23.78■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 FAM227BQ96M60 508 aa23.78■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.78■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 USP14P54578 494 aa23.77■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.77■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.77■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 NAPBQ9H115 298 aa23.77■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.77■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 A0A0D9SFI3 127 aa23.76■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 C12orf42Q96LP6 360 aa23.76■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.75■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 SDSP20132 328 aa23.75■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.75■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.75■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.75■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.75■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 CENPFP49454 3210 aa23.74■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 FOXP2O15409 715 aa23.74■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.74■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.74■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 A0A1W2PRG0 241 aa23.73■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 GNRH1P01148 92 aa23.73■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 PSMC4P43686 418 aa23.73■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 ICA1Q05084 483 aa23.73■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 VPS53Q5VIR6 699 aa23.73■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.73■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 HIP1O00291 1037 aa23.72■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 RASA1P20936 1047 aa23.72■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 TTC22Q5TAA0 569 aa23.72■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.72■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.72■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.71■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 VCAM1P19320 739 aa23.71■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 CTGFP29279 349 aa23.71■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 PPARAQ07869 468 aa23.71■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.71■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.71■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.71■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM47Q96LD4 638 aa23.71■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.71■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.71■■□□□ 1.39
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L15C9J2P7 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L11C9JVI0 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L18D6R9N7 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L22D6RA61 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L19D6RCP7 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L20D6RJB6 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 FCGRTP55899 365 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 HERVK_113P62684 666 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 PDE4BQ07343 736 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L24Q0WX57 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 ALX1Q15699 326 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 SH2D4AQ9H788 454 aa23.7■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 PRDM1O75626 825 aa23.69■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 TMX2Q9Y320 296 aa23.69■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 HOXD10P28358 340 aa23.68■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 PRMT2P55345 433 aa23.68■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 ATP2B2Q01814 1243 aa23.68■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.68■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 MGAMO43451 1857 aa23.67■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 FGAP02671 866 aa23.67■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 LPAR1Q92633 364 aa23.67■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 SRRDQ9UH36 339 aa23.67■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.67■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 VCPKMTQ9H867 229 aa23.66■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.66■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.66■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 ZMYM6O95789 1325 aa23.65■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.65■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.65■■□□□ 1.38
CTPS1-206ENST00000470271 MYPNQ86TC9 1320 aa23.64■■□□□ 1.38
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