RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 CNGA4Q8IV77 575 aa20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 CDHR2Q9BYE9 1310 aa20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 ZNF185O15231 689 aa20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 KRT31Q15323 416 aa20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 WDR93Q6P2C0 686 aa20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 YY1AP1Q9H869 796 aa20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.17■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 PHKG2P15735 406 aa20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 KRT9P35527 623 aa20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 STIM1Q13586 685 aa20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.16■□□□□ 0.82
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PREB-208ENST00000468045 PAGE5Q96GU1 130 aa20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 DEF6Q9H4E7 631 aa20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 WNT7AO00755 349 aa20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
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PREB-208ENST00000468045 AGPSO00116 658 aa20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 MCAMP43121 646 aa20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 FKBP15Q5T1M5 1219 aa20.16■□□□□ 0.82
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PREB-208ENST00000468045 POLD4Q9HCU8 107 aa20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.15■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.15■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.15■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 TUBB2AQ13885 445 aa20.14■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.14■□□□□ 0.82
PREB-208ENST00000468045 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.14■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.14■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 COG1Q8WTW3 980 aa20.14■□□□□ 0.81
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PREB-208ENST00000468045 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.14■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.13■□□□□ 0.81
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PREB-208ENST00000468045 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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PREB-208ENST00000468045 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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PREB-208ENST00000468045 NCAPGQ9BPX3 1015 aa20.13■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.13■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.12■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 IRAK1P51617 712 aa20.12■□□□□ 0.81
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PREB-208ENST00000468045 SHISA4Q96DD7 197 aa20.12■□□□□ 0.81
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PREB-208ENST00000468045 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa20.12■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 ERLIN2O94905 339 aa20.12■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 NDUFA10O95299 355 aa20.12■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 C2orf54Q08AI8 447 aa20.12■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.12■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.12■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.12■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.12■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.12■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 ADD2P35612 726 aa20.11■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.11■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.11■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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PREB-208ENST00000468045 KANK3Q6NY19 840 aa20.11■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
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PREB-208ENST00000468045 PSEN1P49768 467 aa20.11■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.11■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.11■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.11■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.1■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 CYP27B1O15528 508 aa20.1■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.1■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 HERVK_113P62684 666 aa20.1■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 UBXN1Q04323 297 aa20.1■□□□□ 0.81
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