RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.78■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 A0A0D9SFI3 127 aa24.78■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 CAP1Q01518 475 aa24.78■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 KIF22Q14807 665 aa24.78■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 NAPBQ9H115 298 aa24.78■■□□□ 1.56
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VARS-218ENST00000459667 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
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VARS-218ENST00000459667 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.77■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 ACER1Q8TDN7 264 aa24.77■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.77■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.77■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 SDSP20132 328 aa24.76■■□□□ 1.55
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VARS-218ENST00000459667 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.76■■□□□ 1.55
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VARS-218ENST00000459667 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.75■■□□□ 1.55
VARS-218ENST00000459667 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.74■■□□□ 1.55
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VARS-218ENST00000459667 VPS53Q5VIR6 699 aa24.74■■□□□ 1.55
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VARS-218ENST00000459667 RASA1P20936 1047 aa24.73■■□□□ 1.55
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VARS-218ENST00000459667 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.73■■□□□ 1.55
VARS-218ENST00000459667 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.73■■□□□ 1.55
VARS-218ENST00000459667 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.73■■□□□ 1.55
VARS-218ENST00000459667 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.73■■□□□ 1.55
VARS-218ENST00000459667 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.72■■□□□ 1.55
VARS-218ENST00000459667 A0A1W2PRG0 241 aa24.72■■□□□ 1.55
VARS-218ENST00000459667 PSMC4P43686 418 aa24.72■■□□□ 1.55
VARS-218ENST00000459667 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
VARS-218ENST00000459667 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.72■■□□□ 1.55
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VARS-218ENST00000459667 HIP1O00291 1037 aa24.71■■□□□ 1.55
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VARS-218ENST00000459667 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
VARS-218ENST00000459667 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
VARS-218ENST00000459667 VCAM1P19320 739 aa24.71■■□□□ 1.55
VARS-218ENST00000459667 CTGFP29279 349 aa24.71■■□□□ 1.55
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VARS-218ENST00000459667 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.71■■□□□ 1.55
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VARS-218ENST00000459667 PRDM1O75626 825 aa24.7■■□□□ 1.54
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VARS-218ENST00000459667 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.69■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 USP17L11C9JVI0 530 aa24.69■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 USP17L18D6R9N7 530 aa24.69■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 USP17L22D6RA61 530 aa24.69■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.69■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 USP17L19D6RCP7 530 aa24.69■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 USP17L20D6RJB6 530 aa24.69■■□□□ 1.54
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VARS-218ENST00000459667 HERVK_113P62684 666 aa24.69■■□□□ 1.54
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VARS-218ENST00000459667 USP17L24Q0WX57 530 aa24.69■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 ALX1Q15699 326 aa24.69■■□□□ 1.54
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VARS-218ENST00000459667 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.69■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
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VARS-218ENST00000459667 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 TMX2Q9Y320 296 aa24.68■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.67■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.67■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 ZMYM6O95789 1325 aa24.66■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 FGAP02671 866 aa24.66■■□□□ 1.54
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VARS-218ENST00000459667 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.66■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 VCPKMTQ9H867 229 aa24.66■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.66■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 SRRDQ9UH36 339 aa24.66■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 LPAR1Q92633 364 aa24.65■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.65■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 MYPNQ86TC9 1320 aa24.64■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
VARS-218ENST00000459667 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.64■■□□□ 1.54
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