RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 SWAP70Q9UH65 585 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 MINDY4BA8MYZ0 360 aa28.66■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 APPP05067 770 aa28.66■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 NUCB1Q02818 461 aa28.66■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 C16orf86Q6ZW13 317 aa28.66■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 SH3TC2Q8TF17 1288 aa28.66■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 CENPFP49454 3210 aa28.66■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 MGAMO43451 1857 aa28.66■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A1W2PRG0 241 aa28.65■■■□□ 2.18
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SH3BP5-208ENST00000459627 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 SRRDQ9UH36 339 aa28.64■■■□□ 2.18
SH3BP5-208ENST00000459627 MYPNQ86TC9 1320 aa28.64■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
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SH3BP5-208ENST00000459627 PRKCZQ05513 592 aa28.63■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.63■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 EVI5LQ96CN4 794 aa28.63■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.62■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 HERVK_113P62684 666 aa28.62■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa28.62■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa28.62■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
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SH3BP5-208ENST00000459627 SBK1Q52WX2 424 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 POTEEQ6S8J3 1075 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM179Q6ZVK1 233 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 SIAH1Q8IUQ4 282 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 IFNL3Q8IZI9 196 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 RILPL2Q969X0 211 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 C12orf42Q96LP6 360 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 TXNRD2Q9NNW7 524 aa28.61■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 POTEFA5A3E0 1075 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 GNRH1P01148 92 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 GNAT2P19087 354 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 VCAM1P19320 739 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ARMC5Q96C12 935 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM227BQ96M60 508 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 PAGR1Q9BTK6 254 aa28.6■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 HOXD10P28358 340 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 USP14P54578 494 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP2B2Q01814 1243 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 RAET1EQ8TD07 263 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 FOXP2O15409 715 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 PRDM1O75626 825 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ICA1Q05084 483 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 VPS53Q5VIR6 699 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF333Q96JL9 665 aa28.58■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A0D9SFI3 127 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 USP17L15C9J2P7 530 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 USP17L13C9JLJ4 530 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 USP17L11C9JVI0 530 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 USP17L18D6R9N7 530 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 USP17L22D6RA61 530 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 USP17L19D6RCP7 530 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 USP17L20D6RJB6 530 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 RASA1P20936 1047 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 USP17L24Q0WX57 530 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC17Q96LX7 622 aa28.57■■■□□ 2.16
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SH3BP5-208ENST00000459627 TAOK2Q9UL54 1235 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 DOCK3Q8IZD9 2030 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 PDE4AP27815 886 aa28.56■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 FLT3LGP49771 235 aa28.56■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 PRMT2P55345 433 aa28.56■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 Q3C1V9 767 aa28.56■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa28.56■■■□□ 2.16
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SH3BP5-208ENST00000459627 MORF4L1Q9UBU8 362 aa28.56■■■□□ 2.16
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SH3BP5-208ENST00000459627 ROBO3Q96MS0 1386 aa28.54■■■□□ 2.16
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SH3BP5-208ENST00000459627 NBPF11Q86T75 865 aa28.54■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa28.54■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 CNMDO75829 334 aa28.53■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 ELNP15502 786 aa28.53■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 GRK4P32298 578 aa28.53■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 COA7Q96BR5 231 aa28.53■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.53■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 INCENPQ9NQS7 918 aa28.53■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 ERVK-9P63128 1117 aa28.52■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 ERVK-24P63145 666 aa28.52■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 CTDSPL2Q05D32 466 aa28.52■■■□□ 2.16
SH3BP5-208ENST00000459627 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
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