RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456385.5

CLIP4-208, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein family member 4, human

TSL 2

Gene CLIP4, Length 2,311 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLIP4-208	ENST00000456385	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	OXER1	Q8TDS5	423 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	N4BP3	O15049	544 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	KRT31	Q15323	416 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	LY9	Q9HBG7	655 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CLIP4-208	ENST00000456385	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.65	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	ZNF185	O15231	689 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	GC	P02774	474 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	A1BG	P04217	495 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	KRT9	P35527	623 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CCDC51	Q96ER9	411 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	PAGE5	Q96GU1	130 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	FAM205C	A6NFA0	338 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	EBAG9	O00559	213 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	MNAT1	P51948	309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	MAP9	Q49MG5	647 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	KANK3	Q6NY19	840 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CABP5	Q9NP86	173 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	SAMM50	Q9Y512	469 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	MYH8	P13535	1937 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	USP54	Q70EL1	1684 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	NDUFA10	O95299	355 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CEP89	Q96ST8	783 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	STRN4	Q9NRL3	753 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	PSMD14	O00487	310 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	MST1R	Q04912	1400 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	GRIN2D	O15399	1336 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	HERVK_113	P62684	666 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	FAM107B	Q9H098	131 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	TTC26	A0AVF1	554 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	WNT7A	O00755	349 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CLIP4-208	ENST00000456385	MCM3	P25205	808 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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