RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-210	ENST00000440825	CTR9	Q6PD62	1173 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FAAP20-210	ENST00000440825	MYH8	P13535	1937 aa		33.26	■■■□□ 2.92
FAAP20-210	ENST00000440825	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	APP	P05067	770 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	GUCY1A2	P33402	732 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	PRKCZ	Q05513	592 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	IGHD	P01880	384 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	CDK8	P49336	464 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	PDE1A	P54750	535 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	USP14	P54578	494 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	ZNF333	Q96JL9	665 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	GABRQ	Q9UN88	632 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	AKR1B1	P15121	316 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	TDO2	P48775	406 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	POTEF	A5A3E0	1075 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	HERVK_113	P62684	666 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	STAP2	Q9UGK3	403 aa		33.22	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	PEX10	O60683	326 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	GNAT2	P19087	354 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	SMC5	Q8IY18	1101 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	COA7	Q96BR5	231 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	C12orf42	Q96LP6	360 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FAAP20-210	ENST00000440825	USP17L15	C9J2P7	530 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	USP17L11	C9JVI0	530 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	USP17L18	D6R9N7	530 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	USP17L22	D6RA61	530 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	USP17L19	D6RCP7	530 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	USP17L20	D6RJB6	530 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	VCAM1	P19320	739 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	GRK4	P32298	578 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	USP17L24	Q0WX57	530 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825		A0A1W2PRG0	241 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	FLT3LG	P49771	235 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	ATP2B2	Q01814	1243 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	ICA1	Q05084	483 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	EVI5L	Q96CN4	794 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	CCDC17	Q96LX7	622 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	SBK1	Q52WX2	424 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	ADCY3	O60266	1144 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FAAP20-210	ENST00000440825	ELN	P15502	786 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	NUCB1	Q02818	461 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	RILPL2	Q969X0	211 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	ERVK-9	P63128	1117 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	ERVK-24	P63145	666 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	MTFR1	Q15390	333 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	NAPB	Q9H115	298 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	SH2D4A	Q9H788	454 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	RAD21	O60216	631 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	UBXN2A	P68543	259 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825		Q3C1V9	767 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	PRDM1	O75626	825 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAAP20-210	ENST00000440825	RASA1	P20936	1047 aa		33.09	■■■□□ 2.89

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