RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BRCA2P51587 3418 aa11.24□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LCTP09848 1927 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 USP17L5A8MUK1 530 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FGAP02671 866 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ASNSP08243 561 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYP2C8P10632 490 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CETPP11597 493 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BMP2KLQ5H9B9 411 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM47AQ5JRC9 791 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF280CQ8ND82 737 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SWAP70Q9UH65 585 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZMYM6O95789 1325 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RAD50Q92878 1312 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLIN4Q96Q06 1357 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDHXO00330 501 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SGSM2O43147 1006 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NMT2O60551 498 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ICA1Q05084 483 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SIAH1Q8IUQ4 282 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FEZ1Q99689 392 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WDR18Q9BV38 432 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SAGE1Q9NXZ1 904 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HIP1O00291 1037 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CXCL11O14625 94 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ALX1Q15699 326 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AMOTL1Q8IY63 956 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHMP4CQ96CF2 233 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NACAP1Q9BZK3 213 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MCM3APO60318 1980 aa11.21□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VCAM1P19320 739 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CTGFP29279 349 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BACE1P56817 501 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATP2B2Q01814 1243 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STOX1Q6ZVD7 989 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CEP95Q96GE4 821 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CPA4Q9UI42 421 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANAPC4Q9UJX5 808 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 USP17L10C9JJH3 530 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPR25O00155 361 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CA12O43570 354 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EEF2P13639 858 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPICE1Q8N0Z3 855 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CD99L2Q8TCZ2 262 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MKNK2Q9HBH9 465 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CABP5Q9NP86 173 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDC45O75419 566 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TICAM2Q86XR7 235 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STAG1Q8WVM7 1258 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C12orf42Q96LP6 360 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IL17RBQ9NRM6 502 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TOMM22Q9NS69 142 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GINM1Q9NU53 330 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF236Q9UL36 1845 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 B4E1Z4 1266 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ORC4O43929 436 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYP21A2P08686 494 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TFAP4Q01664 338 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AKNAD1Q5T1N1 836 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TXNRD2Q9NNW7 524 aa11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms