RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434481.1

USP9YP3-201, Transcript of USP9Y pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP3, Length 1,766 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP3-201ENST00000434481 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.32□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 CHST12Q9NRB3 414 aa9.32□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.32□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.31□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 FAM83GA6ND36 823 aa9.31□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 NAT2P11245 290 aa9.31□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 PAX3P23760 479 aa9.31□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.31□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa9.31□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 E2F8A0AVK6 867 aa9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 GPR39O43194 453 aa9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 PPFIA4O75335 1185 aa9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 PPP2R2AP63151 447 aa9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 BBS9Q3SYG4 887 aa9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 TMEM201Q5SNT2 666 aa9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 IL17RAQ96F46 866 aa9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 LRP2BPQ9P2M1 347 aa9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.3□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 H7C1W4 665 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 BMP1P13497 986 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 PASD1Q8IV76 773 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 HOOK2Q96ED9 719 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 TACC3Q9Y6A5 838 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 CPB1P15086 417 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 RAG1P15918 1043 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 NEK4P51957 841 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 CABP4P57796 275 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 STAT4Q14765 748 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 FAM35AQ86V20 835 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.29□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 MAP3K1Q13233 1512 aa9.28□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 BRINP1O60477 761 aa9.28□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 NPTXRO95502 500 aa9.28□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 DHCR24Q15392 516 aa9.28□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 VPS72Q15906 364 aa9.28□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.28□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 PPP1R14AQ96A00 147 aa9.28□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 SH3BP5O60239 455 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 PRR20EP86478 221 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 PRR20CP86479 221 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 PRR20DP86480 221 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 PRR20BP86481 221 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 PRR20AP86496 221 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 GSTM4Q03013 218 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 MLC1Q15049 377 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 FAM182BQ5T319 152 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 NXNQ6DKJ4 435 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 KSR2Q6VAB6 950 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.92
USP9YP3-201ENST00000434481 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 TIAM1Q13009 1591 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 GOLGA6BA6NDN3 693 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 FGFR1P11362 822 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 FAM102BQ5T8I3 360 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 KRT82Q9NSB4 513 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 ZNF180Q9UJW8 692 aa9.27□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.26□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 PRODHO43272 600 aa9.26□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 PGRP06401 933 aa9.26□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 EPHA1P21709 976 aa9.26□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 PMS1P54277 932 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
USP9YP3-201ENST00000434481 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms