RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424263.6

PRDM11-201, Transcript of PR/SET domain 11, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene PRDM11, Length 1,858 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM11-201ENST00000424263 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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PRDM11-201ENST00000424263 MCM5P33992 734 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 NOVP48745 357 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 ICA1Q05084 483 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 IQCA1Q86XH1 822 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 ERO1BQ86YB8 467 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 USP17L5A8MUK1 530 aa23.47■■□□□ 1.35
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PRDM11-201ENST00000424263 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 CHST3Q7LGC8 479 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.47■■□□□ 1.35
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PRDM11-201ENST00000424263 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
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PRDM11-201ENST00000424263 PPATQ06203 517 aa23.45■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.45■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 OPTNQ96CV9 577 aa23.45■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.45■■□□□ 1.35
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PRDM11-201ENST00000424263 WDR18Q9BV38 432 aa23.45■■□□□ 1.35
PRDM11-201ENST00000424263 RPS6KB1P23443 525 aa23.45■■□□□ 1.34
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PRDM11-201ENST00000424263 RUFY3Q7L099 469 aa23.45■■□□□ 1.34
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PRDM11-201ENST00000424263 OTUD5Q96G74 571 aa23.45■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 MTA3Q9BTC8 594 aa23.45■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.45■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
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PRDM11-201ENST00000424263 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.45■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 TTLL1O95922 423 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 C1QTNF8P60827 252 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 PPIL2Q13356 520 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 SEC23AQ15436 765 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 WNK4Q96J92 1243 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 NYAP2Q9P242 653 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.43■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 ACER1Q8TDN7 264 aa23.43■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.43■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 A0A1W2PRG0 241 aa23.43■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 RASSF10A6NK89 507 aa23.43■■□□□ 1.34
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PRDM11-201ENST00000424263 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.43■■□□□ 1.34
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PRDM11-201ENST00000424263 STX8Q9UNK0 236 aa23.43■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 PARP14Q460N5 1801 aa23.43■■□□□ 1.34
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PRDM11-201ENST00000424263 IRF6O14896 467 aa23.42■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 ECE1P42892 770 aa23.42■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 BECN1Q14457 450 aa23.42■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 DGKHQ86XP1 1220 aa23.42■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 ANKS1AQ92625 1134 aa23.42■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 TTC14Q96N46 770 aa23.42■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.42■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 SLC10A3P09131 477 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 SPRYD7Q5W111 196 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 MKL1Q969V6 931 aa23.41■■□□□ 1.34
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PRDM11-201ENST00000424263 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 TRIM75PA6NK02 468 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 ATP2B2Q01814 1243 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 SPP2Q13103 211 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 LY9Q9HBG7 655 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 SENP2Q9HC62 589 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 TMX2Q9Y320 296 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 FBXL16Q8N461 479 aa23.4■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.4■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.4■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 ERICH2A1L162 156 aa23.39■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 MTMR2Q13614 643 aa23.39■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 WTAPQ15007 396 aa23.39■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.39■■□□□ 1.34
PRDM11-201ENST00000424263 SH2D4AQ9H788 454 aa23.39■■□□□ 1.34
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