RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 SH3TC2Q8TF17 1288 aa9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.22□□□□□ -0.93
SGMS1-201ENST00000361543 FEZ1Q99689 392 aa9.22□□□□□ -0.93
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SGMS1-201ENST00000361543 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.18□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.18□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.18□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PRG0 241 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 PEX10O60683 326 aa9.17□□□□□ -0.94
SGMS1-201ENST00000361543 NEFLP07196 543 aa9.17□□□□□ -0.94
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