RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLA2R1Q13018 1463 aa18.11■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KCNQ3O43525 872 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PDE8BO95263 885 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BCRP11274 1271 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EIF6P56537 245 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC8A3P57103 927 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NCAPH2Q6IBW4 605 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C8orf74Q6P047 294 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IFT20Q8IY31 132 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BLIDQ8IZY5 108 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC121Q6ZUS5 278 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KAT6BQ8WYB5 2073 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MYL10Q9BUA6 226 aa18.1■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.1■□□□□ 0.491e-6■■■□□ 15.7
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPOPO43791 374 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TNFAIP1Q13829 316 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LARGE2Q8N3Y3 721 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IFT81Q8WYA0 676 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PFKFB1P16118 471 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRAPPC10P48553 1259 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MYRIPQ8NFW9 859 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KCNJ14Q9UNX9 436 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 USP17L12C9JPN9 530 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 USP17L21D6R901 530 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GOLGA5Q8TBA6 731 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MAIP1Q8WWC4 291 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ABCC3O15438 1527 aa18.09■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SMCO2A6NFE2 343 aa18.08■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LAD1O00515 517 aa18.08■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MAGEA1P43355 309 aa18.08■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLFN12Q8IYM2 578 aa18.08■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAM212AQ96EL1 285 aa18.08■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa18.08■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 VPS54Q9P1Q0 977 aa18.08■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TXNDC16Q9P2K2 825 aa18.08■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC169A6NNP5 214 aa18.08■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 USP21Q9UK80 565 aa18.08■□□□□ 0.49
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PTCH1Q13635 1447 aa18.08■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 VPS18Q9P253 973 aa18.08■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GJC1P36383 396 aa18.08■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CUEDC2Q9H467 287 aa18.08■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TNKSO95271 1327 aa18.08■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FGAP02671 866 aa18.08■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SAMD15Q9P1V8 674 aa18.08■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RSPH14Q9UHP6 348 aa18.08■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMEM94Q12767 1356 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SCG2P13521 617 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KRT5P13647 590 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DLGAP5Q15398 846 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MFSD14BQ5SR56 506 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SMC6Q96SB8 1091 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LEMD3Q9Y2U8 911 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SFMBT2Q5VUG0 894 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SERTAD1Q9UHV2 236 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LONP1P36776 959 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SELENOSQ9BQE4 189 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 H0YCG3 227 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRPC3Q13507 836 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CPLX4Q7Z7G2 160 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NIM1KQ8IY84 436 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ROBO2Q9HCK4 1378 aa18.07■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 WDR17Q8IZU2 1322 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 H7C1D1 291 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PPP2R5EQ16537 467 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MSL1Q68DK7 614 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 USP40Q9NVE5 1235 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TAB2Q9NYJ8 693 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CHMP2AO43633 222 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NLRX1Q86UT6 975 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CEP63Q96MT8 703 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RTEL1Q9NZ71 1219 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SWAP70Q9UH65 585 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ERVV-1B6SEH8 477 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RUFY4Q6ZNE9 571 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 USP28Q96RU2 1077 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AS3MTQ9HBK9 375 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 hCG_1984214I3L0E3 225 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PNMA1Q8ND90 353 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa18.06■□□□□ 0.48
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms