RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359683.8

NIF3L1-201, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NIF3L1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1-201ENST00000359683 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.63□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 MOB2Q70IA6 237 aa14.63□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 RUFY3Q7L099 469 aa14.63□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.63□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 CABP5Q9NP86 173 aa14.63□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.63□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.62□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 CPA1P15085 419 aa14.62□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 RPS6KB1P23443 525 aa14.62□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 NOVP48745 357 aa14.62□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.62□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.62□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 CAPNS2Q96L46 248 aa14.62□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.62□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.62□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 PRC1O43663 620 aa14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 ECE1P42892 770 aa14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 LBX1P52954 281 aa14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 CHST3Q7LGC8 479 aa14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 IQCA1Q86XH1 822 aa14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 ANKS1AQ92625 1134 aa14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 TLL2Q9Y6L7 1015 aa14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 NMT2O60551 498 aa14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 VGLL4Q14135 290 aa14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 SEPT2Q15019 361 aa14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 RABEP1Q15276 862 aa14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 SEC23AQ15436 765 aa14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 FBXL16Q8N461 479 aa14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 IL27Q8NEV9 243 aa14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 TMEM87BQ96K49 555 aa14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 TTC14Q96N46 770 aa14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.6□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 PTPRAP18433 802 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 DGKHQ86XP1 1220 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 CEP95Q96GE4 821 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 PICK1Q9NRD5 415 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 NYAP2Q9P242 653 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 CSADQ9Y600 493 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 TNKSO95271 1327 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 USP17L5A8MUK1 530 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 NEK4P51957 841 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 MKL1Q969V6 931 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.59□□□□□ -0.07
NIF3L1-201ENST00000359683 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 LIFRP42702 1097 aa14.58□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.58□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 Q6ZUG5 572 aa14.58□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 WDR18Q9BV38 432 aa14.58□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.58□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 DOCK1Q14185 1865 aa14.58□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 ATAD5Q96QE3 1844 aa14.58□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 OTOFQ9HC10 1997 aa14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 ERICH2A1L162 156 aa14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 TTLL1O95922 423 aa14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 ICA1Q05084 483 aa14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 WTAPQ15007 396 aa14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 ERO1BQ86YB8 467 aa14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 TMTC2Q8N394 836 aa14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 LY9Q9HBG7 655 aa14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.57□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.56□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 AOC2O75106 756 aa14.56□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 HUNKP57058 714 aa14.56□□□□□ -0.08
NIF3L1-201ENST00000359683 PPATQ06203 517 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms