RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
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RABGGTB-201ENST00000319942 USP17L4A6NCW7 530 aa11.83□□□□□ -0.52
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RABGGTB-201ENST00000319942 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 CYB5R4Q7L1T6 521 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.83□□□□□ -0.52
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RABGGTB-201ENST00000319942 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa11.83□□□□□ -0.52
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RABGGTB-201ENST00000319942 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 TEKT1Q969V4 418 aa11.83□□□□□ -0.52
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RABGGTB-201ENST00000319942 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.83□□□□□ -0.52
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RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa11.82□□□□□ -0.52
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RABGGTB-201ENST00000319942 TRAK2O60296 914 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 RCAN1P53805 252 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 AOC3Q16853 763 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 MCTP1Q6DN14 999 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 APOA5Q6Q788 366 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 CERS5Q8N5B7 392 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-201ENST00000319942 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
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