RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 SPATA20Q8TB22 786 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 CASZ1Q86V15 1759 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 FOXN1O15353 648 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 PDE4BQ07343 736 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 ZPR1O75312 459 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 ATP2B1P20020 1258 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 PRDM1O75626 825 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 DPF2Q92785 391 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 TMX1Q9H3N1 280 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 SMIM22K7EJ46 135 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 TRAPPC10P48553 1259 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 SHISA4Q96DD7 197 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-201ENST00000311008 TAF1P21675 1872 aa22.33■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 SLFN14P0C7P3 912 aa22.33■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF18P17022 549 aa22.33■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 VPS72Q15906 364 aa22.33■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 PRR29P0C7W0 189 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 PLCD1P51178 756 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 TNFRSF25Q93038 417 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 KIF5BP33176 963 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 PDILTQ8N807 584 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 ERO1AQ96HE7 468 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 KLRK1P26718 216 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 LAMB1P07942 1786 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 TTC38Q5R3I4 469 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 SCG2P13521 617 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 GSDMAQ96QA5 445 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 ZMYND15Q9H091 742 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 TSPY2A6NKD2 308 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 PRDX5P30044 214 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 NPY5RQ15761 445 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 USP49Q70CQ1 688 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 DHX58Q96C10 678 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 FEZ1Q99689 392 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 FAM205CA6NFA0 338 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGAP6O43182 974 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 ZSCAN12O43309 604 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 CALML3P27482 149 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.163e-12■■■■■ 43.2
SPNS1-201ENST00000311008 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 GNPATO15228 680 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 KCNQ4P56696 695 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 NLRP5P59047 1200 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 DGKHQ86XP1 1220 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 PAGE5Q96GU1 130 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 EPSTI1Q96J88 318 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 INTS13Q9NVM9 706 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM232C9JQI7 657 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 TM4SF1P30408 202 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 ANKS1AQ92625 1134 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-201ENST00000311008 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.27■■□□□ 1.15
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-201ENST00000311008 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-201ENST00000311008 GSTO1P78417 241 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF174Q15697 407 aa22.26■■□□□ 1.15
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