RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 I3L4J1 428 aa26.78■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 PFKFB1P16118 471 aa26.78■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa26.78■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3BP5O60239 455 aa26.78■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 MYCT1Q8N699 235 aa26.78■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 TSC1Q92574 1164 aa26.78■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 BCRP11274 1271 aa26.78■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT15P19012 456 aa26.78■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 MAEAQ7L5Y9 396 aa26.78■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1468Q9P260 1216 aa26.78■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC8A3P57103 927 aa26.77■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 GCNT3O95395 438 aa26.77■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 PLCD3Q8N3E9 789 aa26.77■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB17Q9H0T7 212 aa26.77■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 LONRF2Q1L5Z9 754 aa26.77■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.77■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 NR1I2O75469 434 aa26.77■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.77■■□□□ 1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 EXOC3O60645 756 aa26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP120Q8N960 986 aa26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 PFDN4Q9NQP4 134 aa26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF532Q9HCE3 1301 aa26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 GUCY2FP51841 1108 aa26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 MYO1AQ9UBC5 1043 aa26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 PARP2Q9UGN5 583 aa26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 DAPK3O43293 454 aa26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 UFL1O94874 794 aa26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 LZTS2Q9BRK4 669 aa26.76■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF34Q969K3 372 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNJ18B7U540 433 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 GNGT1P63211 74 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNJ12Q14500 433 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 PARP10Q53GL7 1025 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA5Q8NB90 893 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 CLGNO14967 610 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 ZAP70P43403 619 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 DCUN1D2Q6PH85 259 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 MGARPQ8TDB4 240 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 DESI2Q9BSY9 194 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.75■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 LGSNQ5TDP6 509 aa26.74■■□□□ 1.87
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GNPTAB-201ENST00000299314 VCXQ9H320 206 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 NLRC4Q9NPP4 1024 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA8KD6RF30 607 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 LPIN2Q92539 896 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 EPSTI1Q96J88 318 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 SBNO1A3KN83 1393 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D8O95759 1140 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa26.74■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 TAF5LO75529 589 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC38Q502W7 563 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 MAIP1Q8WWC4 291 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 SSH2Q76I76 1423 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS37BQ9H9H4 285 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 AMFRQ9UKV5 643 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 GNA14O95837 355 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMD6Q15008 389 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD42Q8N9B4 389 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP10BO94823 1461 aa26.73■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 MORC3Q14149 939 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 UIMC1Q96RL1 719 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 EFCAB8A8MWE9 144 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 GCKRQ14397 625 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC8AQ8IWT6 810 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 NUF2Q9BZD4 464 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 TAF12Q16514 161 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 OR8K1Q8NGG5 319 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 LRMPQ12912 555 aa26.72■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF40O75150 1001 aa26.71■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF3CO14782 793 aa26.71■■□□□ 1.87
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D31Q96DN5 1066 aa26.71■■□□□ 1.87
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